230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0089 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  100 
 
 		 807 aa  1549    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  50.79 
 
 		 828 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  40.53 
 
 		 852 aa  480  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  36.47 
 
 		 854 aa  419  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  37.43 
 
 		 863 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  33.53 
 
 		 855 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  38.88 
 
 		 822 aa  365  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  37.56 
 
 		 822 aa  330  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  33.81 
 
 		 874 aa  233  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  31.43 
 
 		 841 aa  205  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  34.05 
 
 		 867 aa  200  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  32.55 
 
 		 838 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  29.56 
 
 		 838 aa  190  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0269  hypothetical protein  30.08 
 
 		 823 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  27.34 
 
 		 843 aa  171  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  31.38 
 
 		 845 aa  158  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4404  protein of unknown function DUF214  31.62 
 
 		 822 aa  154  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  26.18 
 
 		 842 aa  142  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  28.02 
 
 		 855 aa  141  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  29.97 
 
 		 848 aa  139  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  28.52 
 
 		 853 aa  139  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  27.45 
 
 		 834 aa  134  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4607  protein of unknown function DUF214  30.26 
 
 		 852 aa  129  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.764847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  28.66 
 
 		 847 aa  129  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  26.41 
 
 		 852 aa  127  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 		 806 aa  127  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  31.99 
 
 		 839 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  23.19 
 
 		 854 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  26.01 
 
 		 856 aa  110  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  28.43 
 
 		 648 aa  109  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  29.57 
 
 		 841 aa  108  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  26.78 
 
 		 849 aa  107  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  27.17 
 
 		 849 aa  105  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  27.22 
 
 		 861 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  26.03 
 
 		 825 aa  102  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  26.18 
 
 		 836 aa  99.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  26.85 
 
 		 838 aa  94.4  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  27.13 
 
 		 853 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4658  protein of unknown function DUF214  30.2 
 
 		 638 aa  88.6  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  26.52 
 
 		 850 aa  87  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  24.49 
 
 		 873 aa  83.6  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  26.32 
 
 		 859 aa  82.4  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.38 
 
 		 851 aa  82  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  25.74 
 
 		 821 aa  81.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7745  hypothetical protein  41.6 
 
 		 445 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.99 
 
 		 857 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  21.39 
 
 		 858 aa  77.8  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  24.67 
 
 		 414 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  29.62 
 
 		 640 aa  71.2  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.983976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  26.63 
 
 		 855 aa  71.2  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  31.5 
 
 		 866 aa  70.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  27.04 
 
 		 930 aa  67  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1915  protein of unknown function DUF214  33.7 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.85 
 
 		 835 aa  65.9  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0940  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.5 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  39.87 
 
 		 846 aa  62.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1964  protein of unknown function DUF214  35.58 
 
 		 643 aa  62.4  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  26.72 
 
 		 833 aa  62  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.62 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  44.58 
 
 		 801 aa  58.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2811  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0243258  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  29.92 
 
 		 413 aa  57  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.39 
 
 		 411 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.81 
 
 		 408 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  27.98 
 
 		 857 aa  56.6  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  24.81 
 
 		 381 aa  56.2  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  24.77 
 
 		 380 aa  55.5  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2109  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  32.33 
 
 		 416 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  27.81 
 
 		 861 aa  55.1  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  27.22 
 
 		 386 aa  54.7  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1856  ABC transporter related  24.61 
 
 		 660 aa  54.7  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  29.24 
 
 		 386 aa  54.3  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.44 
 
 		 427 aa  53.5  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  31.58 
 
 		 416 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  29.86 
 
 		 425 aa  53.9  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.31 
 
 		 421 aa  53.5  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  39.81 
 
 		 846 aa  53.5  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  32.84 
 
 		 858 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3344  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.03 
 
 		 415 aa  53.9  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4568  ABC transporter, permease protein  26.7 
 
 		 637 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.01 
 
 		 664 aa  53.5  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  32.58 
 
 		 662 aa  53.5  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  28.57 
 
 		 386 aa  53.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  21.23 
 
 		 868 aa  52.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  29 
 
 		 386 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  18.69 
 
 		 856 aa  52.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3479  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  22.04 
 
 		 422 aa  52.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.640884  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  30.86 
 
 		 379 aa  52.4  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.69 
 
 		 414 aa  52  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0558  protein of unknown function DUF214  27.8 
 
 		 831 aa  52  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2360  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.47 
 
 		 411 aa  51.6  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.069448  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.62 
 
 		 411 aa  51.6  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0477  protein of unknown function DUF214  21.24 
 
 		 835 aa  52  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2259  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC, putative  25.09 
 
 		 416 aa  51.6  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  31.75 
 
 		 371 aa  51.6  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  23.19 
 
 		 422 aa  51.6  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  29.92 
 
 		 408 aa  51.6  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1734  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.36 
 
 		 416 aa  51.2  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00172788  normal  0.754695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2149  protein of unknown function DUF214  34.65 
 
 		 831 aa  51.2  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  35.22 
 
 		 787 aa  51.2  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>