19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0084 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0084  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  285  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6457  hypothetical protein  43.48 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314742  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4016  hypothetical protein  43.38 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5770  hypothetical protein  36.36 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  26.98 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  29.13 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  26.19 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  31.58 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7265  hypothetical protein  32.06 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  29.46 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  32.5 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  28.03 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  27.69 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  29.32 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0863  hypothetical protein  28.57 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.845783  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  26.4 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  27.78 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  25.2 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  27.27 
 
 		 133 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>