70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0076 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0076  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  46.61 
 
 		 231 aa  221  9e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0120  nuclease  35.2 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.9034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  35.53 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  33.33 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  34.51 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  28.57 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  29.32 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  29.32 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  30.87 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  32.05 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  29.38 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  34.35 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  34.35 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  29.5 
 
 		 175 aa  62  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  28.57 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  30.05 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  28.68 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  28.38 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  29.07 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  30.07 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  30 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  28.91 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2566  hypothetical protein  48.78 
 
 		 304 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  0.360636 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  30.47 
 
 		 286 aa  52  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  25 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  32.14 
 
 		 327 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  25.49 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  31.55 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  34.11 
 
 		 191 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  28.07 
 
 		 197 aa  50.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4550  S-layer protein  40 
 
 		 276 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4918  putative S-layer protein  46.55 
 
 		 272 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4952  S-layer protein, putative  46.55 
 
 		 272 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4937  putative S-layer protein  46.55 
 
 		 272 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  28.28 
 
 		 153 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  29.79 
 
 		 153 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  28.76 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  26.17 
 
 		 196 aa  46.6  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4693  S-layer protein  46.55 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2735  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 		 383 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000147133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5054  S-layer protein  46.55 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  27.46 
 
 		 218 aa  46.2  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  27.89 
 
 		 166 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  28.46 
 
 		 382 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  31.54 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  29.84 
 
 		 162 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  25.65 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  27.21 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  27.73 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  24.84 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3931  Excalibur domain protein  52.63 
 
 		 77 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  27.61 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4533  S-layer protein  53.85 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  27.42 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  27.21 
 
 		 214 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  27.21 
 
 		 214 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  28.68 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  25.58 
 
 		 174 aa  43.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0504  Excalibur  59.46 
 
 		 138 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  28.23 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  23.65 
 
 		 171 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  28.24 
 
 		 351 aa  42.7  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  25.34 
 
 		 272 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  25.7 
 
 		 238 aa  42.7  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  24.35 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  27.13 
 
 		 166 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  26.62 
 
 		 192 aa  42.4  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  23.13 
 
 		 249 aa  42.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>