78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0063 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0063  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  749    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3510  polysaccharide deacetylase  68.86 
 
 		 348 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1476  polysaccharide deacetylase  48.06 
 
 		 353 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.412903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2851  polysaccharide deacetylase  49.56 
 
 		 371 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000258612  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2055  polysaccharide deacetylase  55.76 
 
 		 341 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0154503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2967  hypothetical protein  48.39 
 
 		 363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24520  predicted xylanase/chitin deacetylase  50.72 
 
 		 292 aa  262  6.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.417407 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0434  polysaccharide deacetylase  30.51 
 
 		 382 aa  176  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1341  polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 		 379 aa  156  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000820876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0175  polysaccharide deacetylase  34.93 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.122625  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0080  polysaccharide deacetylase  30.74 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  27.32 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  25.85 
 
 		 289 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  36.71 
 
 		 594 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 598 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  23.5 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  24.31 
 
 		 291 aa  53.9  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 		 1001 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  25.13 
 
 		 352 aa  53.1  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  25.6 
 
 		 233 aa  52.8  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 258 aa  52.8  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  28.08 
 
 		 342 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  28.57 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  27.75 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 		 348 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  25.2 
 
 		 233 aa  52.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 		 615 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 		 615 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  28.42 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 		 348 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  23.86 
 
 		 282 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 		 348 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  21.25 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  26.11 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  24.34 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  27.89 
 
 		 348 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  26.84 
 
 		 244 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  24.74 
 
 		 253 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  25.79 
 
 		 233 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 626 aa  47  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 278 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 270 aa  47  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18670  predicted xylanase/chitin deacetylase  32.34 
 
 		 289 aa  46.2  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  24.76 
 
 		 238 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  27.27 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0303  polysaccharide deacetylase-like protein  24.88 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  24.76 
 
 		 238 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  42.19 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  42.19 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0331  polysaccharide deacetylase-like protein  24.88 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0363  polysaccharide deacetylase  24.88 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0298  polysaccharide deacetylase  27.13 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  25.13 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0316  polysaccharide deacetylase-like protein  24.88 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  42.19 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  22.5 
 
 		 627 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  23.12 
 
 		 645 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  23.31 
 
 		 357 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  24.88 
 
 		 283 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  29.76 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  30.84 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  24.87 
 
 		 277 aa  43.5  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0310  polysaccharide deacetylase  26.2 
 
 		 358 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4943  polysaccharide deacetylase-like protein  26.6 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0377  polysaccharide deacetylase-like protein  26.6 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 		 321 aa  43.1  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  22.29 
 
 		 275 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 344 aa  42.7  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 		 299 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0404  polysaccharide deacetylase-like protein  26.2 
 
 		 360 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.606713  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  32.84 
 
 		 256 aa  42.7  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0360  polysaccharide deacetylase-like protein  26.6 
 
 		 360 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>