More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0062 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  100 
 
 		 418 aa  791    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  74.5 
 
 		 431 aa  528  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 417 aa  246  6.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  37.2 
 
 		 459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 		 410 aa  240  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 415 aa  203  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 429 aa  196  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  34.42 
 
 		 412 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4528  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.392098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  36.05 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  34.56 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4617  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 455 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117227  hitchhiker  0.000601374 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  31.81 
 
 		 424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  31.81 
 
 		 424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1062  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 423 aa  117  6e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264864  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 443 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4887  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 424 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  31.23 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4530  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  25.37 
 
 		 420 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  26.49 
 
 		 420 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14790  Major Facilitator Superfamily transporter  31.01 
 
 		 464 aa  94.4  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  26.87 
 
 		 420 aa  94  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  26.24 
 
 		 420 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  26.24 
 
 		 420 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  26.13 
 
 		 420 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  25.12 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2819  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 462 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000630163  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  20.17 
 
 		 1833 aa  90.9  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  22.64 
 
 		 412 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  26.37 
 
 		 420 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 416 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  27.29 
 
 		 446 aa  86.3  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  24.74 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  29.65 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  24.74 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  24.74 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  24.74 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  24.74 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  24.74 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  25.51 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  24.74 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2440  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0092  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.031642  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  25 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  24 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  24 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  24.27 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  24.86 
 
 		 1816 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1625  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.568704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  24.34 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2297  putative membrane transport protein  42.42 
 
 		 163 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  30.88 
 
 		 530 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  25 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  24.74 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4777  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.881248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  22.77 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 463 aa  73.2  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  24.74 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  28.91 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0867  putative membrane transport protein  33.79 
 
 		 321 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  30.38 
 
 		 535 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  24.48 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  21.12 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 441 aa  69.7  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  24.48 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  25.98 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  23.6 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  28.83 
 
 		 532 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>