198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0057 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  62.64 
 
 
202 aa  216  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  51.69 
 
 
195 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  55 
 
 
199 aa  178  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  47.24 
 
 
202 aa  156  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  45.66 
 
 
265 aa  154  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  42.64 
 
 
219 aa  153  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  42.2 
 
 
220 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  39.81 
 
 
207 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  49.02 
 
 
213 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  49.02 
 
 
213 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  49.02 
 
 
213 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  44.12 
 
 
213 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  43.62 
 
 
207 aa  142  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  52.98 
 
 
227 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  46.33 
 
 
215 aa  141  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  44.39 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  41.71 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  47.13 
 
 
231 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  45.78 
 
 
227 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  40.6 
 
 
232 aa  136  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  44.26 
 
 
237 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  40.56 
 
 
206 aa  135  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  44.65 
 
 
209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  42.93 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  46.91 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  44.83 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  44.32 
 
 
228 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  44.32 
 
 
228 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  44.57 
 
 
229 aa  131  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  42.16 
 
 
189 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  39.89 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  44.81 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  43.35 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  34.65 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  34.65 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  38.25 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  38.25 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  34.21 
 
 
227 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  46.3 
 
 
217 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  38.22 
 
 
205 aa  121  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  34.84 
 
 
243 aa  121  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  36.68 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  40.26 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  40.79 
 
 
197 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  42.11 
 
 
227 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  40.79 
 
 
197 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  38.5 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  41.24 
 
 
212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  34.58 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  34.58 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  33.51 
 
 
179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  42.11 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  40 
 
 
217 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  39.47 
 
 
223 aa  111  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  35.52 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  32.97 
 
 
179 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  37.28 
 
 
197 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  36.95 
 
 
224 aa  105  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  39.47 
 
 
197 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  31.96 
 
 
207 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  33.15 
 
 
264 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  35.09 
 
 
257 aa  99  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  32.13 
 
 
237 aa  98.6  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  33.15 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  32.98 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  35.26 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  36.48 
 
 
222 aa  95.9  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  30.77 
 
 
271 aa  95.5  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7907  hypothetical protein  39.18 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  35.85 
 
 
221 aa  94  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3397  hypothetical protein  36.36 
 
 
199 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  30.53 
 
 
270 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  38.61 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  34.16 
 
 
191 aa  92  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  31.74 
 
 
199 aa  91.7  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  36.65 
 
 
231 aa  90.5  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  35.06 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  34.87 
 
 
198 aa  88.2  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  34.38 
 
 
218 aa  87  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  36.18 
 
 
263 aa  87  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1648  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  85.9  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174345  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  27.35 
 
 
248 aa  85.1  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  35.15 
 
 
229 aa  85.1  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1633  hypothetical protein  34.15 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  36.6 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  31.47 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  31.53 
 
 
232 aa  81.6  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  37.09 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  33.76 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  28.64 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  35.8 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  32.5 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  33.7 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  31.28 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  32.3 
 
 
239 aa  79  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  32.56 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  35.17 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  28.9 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  30.18 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>