24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0049 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0049  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  339  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5874  hypothetical protein  43.79 
 
 
167 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6383  hypothetical protein  43.79 
 
 
167 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138397  normal  0.269934 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5510  hypothetical protein  43.79 
 
 
167 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311997  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7212  hypothetical protein  43.2 
 
 
167 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.678924  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7213  hypothetical protein  30.67 
 
 
296 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374568  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5511  hypothetical protein  31.29 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588326  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6384  hypothetical protein  30.06 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.468539  normal  0.272426 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5875  hypothetical protein  31.29 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.249656 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0668  hypothetical protein  32.39 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4993  hypothetical protein  29.74 
 
 
191 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3136  hypothetical protein  29.74 
 
 
191 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594994  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4715  hypothetical protein  26.75 
 
 
157 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.674099 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0558  hypothetical protein  26.7 
 
 
185 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.710373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0386  hypothetical protein  26.7 
 
 
185 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4087  hypothetical protein  27.01 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3238  hypothetical protein  27.01 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.454233 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4279  hypothetical protein  27.01 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2413  hypothetical protein  30.77 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000103288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2424  hypothetical protein  27.87 
 
 
173 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4277  hypothetical protein  24.57 
 
 
184 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4089  hypothetical protein  24.57 
 
 
184 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3240  hypothetical protein  24 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456949 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0385  hypothetical protein  24.1 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>