More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0034 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  100 
 
 		 392 aa  802    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4644  alkaline D-peptidase  44.47 
 
 		 397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00635481  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  44.01 
 
 		 443 aa  276  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  39.95 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0467  beta-lactamase  42.55 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  decreased coverage  0.000353045 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  40.2 
 
 		 385 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  41.5 
 
 		 385 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  40.46 
 
 		 375 aa  269  7e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40.21 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  39.69 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  42.03 
 
 		 389 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  39.79 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  40.46 
 
 		 388 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  40.05 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  39.79 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  39.79 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  40.05 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  39.79 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  41.26 
 
 		 407 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  42.57 
 
 		 407 aa  263  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  42.27 
 
 		 389 aa  263  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  39.8 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  39.8 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.78 
 
 		 389 aa  263  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  39.28 
 
 		 388 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  39.85 
 
 		 388 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  43.07 
 
 		 385 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  39.58 
 
 		 720 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2565  beta-lactamase  40.86 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129252  normal  0.077085 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  41.1 
 
 		 388 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  39.59 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  40.26 
 
 		 388 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8159  alkaline D-peptidase  42.02 
 
 		 375 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.533807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5597  beta-lactamase  38.81 
 
 		 406 aa  243  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40.05 
 
 		 390 aa  240  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.99 
 
 		 421 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40.87 
 
 		 416 aa  239  6.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  43.87 
 
 		 429 aa  239  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  41.5 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  43.03 
 
 		 409 aa  232  8.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40.33 
 
 		 411 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  38.99 
 
 		 366 aa  229  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.14 
 
 		 399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  40.46 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  37.1 
 
 		 378 aa  217  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  41.53 
 
 		 349 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  43.75 
 
 		 414 aa  209  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  39.81 
 
 		 383 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  37.4 
 
 		 514 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4687  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40.53 
 
 		 373 aa  209  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  39.64 
 
 		 374 aa  205  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  38.69 
 
 		 459 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.52 
 
 		 383 aa  202  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  38.32 
 
 		 378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.48 
 
 		 378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.04 
 
 		 415 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1771  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.27 
 
 		 380 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.1791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0398  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.8 
 
 		 366 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  35.92 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.82 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00394326  normal  0.37742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3986  hypothetical protein  35.65 
 
 		 369 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  36.29 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1263  beta-lactamase  33.43 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0172767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  34.77 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  31.39 
 
 		 420 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.69 
 
 		 413 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  33.14 
 
 		 374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  34.45 
 
 		 381 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  32.22 
 
 		 416 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5306  beta-lactamase  34.59 
 
 		 411 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  31.96 
 
 		 713 aa  153  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  35.91 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  35.89 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  34.36 
 
 		 740 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0278  beta-lactamase  33.05 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2114  hypothetical protein  40.2 
 
 		 213 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.321684  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3281  beta-lactamase  35.71 
 
 		 414 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.07 
 
 		 447 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35 
 
 		 383 aa  142  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  29.53 
 
 		 371 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 		 447 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.77 
 
 		 447 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  29.91 
 
 		 371 aa  139  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  33.62 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  32.89 
 
 		 2457 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.66 
 
 		 406 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  32 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2405  beta-lactamase  32.75 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261903  hitchhiker  0.00562199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.8 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2921  beta-lactamase class C-like protein  31.74 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.22 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4398  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.14 
 
 		 680 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.419571  decreased coverage  0.00211504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  31.7 
 
 		 380 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  31.93 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.63 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.73 
 
 		 420 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.36 
 
 		 405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.73 
 
 		 420 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4430  beta-lactamase  30.85 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  32.25 
 
 		 578 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>