52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0013 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  835  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  38.77 
 
 
363 aa  174  2e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  41.8 
 
 
288 aa  156  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4607  hypothetical protein  34.31 
 
 
369 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  37.46 
 
 
514 aa  136  7e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  31.02 
 
 
411 aa  135  1e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  30.18 
 
 
400 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  28.46 
 
 
403 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0510  helix-turn-helix domain-containing protein  30.03 
 
 
473 aa  93.2  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  30.12 
 
 
434 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  29.41 
 
 
537 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  27.69 
 
 
441 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  25.96 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0250  XRE family transcriptional regulator  33.6 
 
 
335 aa  86.7  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  28.24 
 
 
431 aa  83.2  7e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  8.09201e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  27.31 
 
 
503 aa  80.9  4e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  29.26 
 
 
519 aa  74.7  3e-12  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.2 
 
 
418 aa  74.7  3e-12  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  26.14 
 
 
526 aa  72  2e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  30.99 
 
 
519 aa  70.1  6e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  26.19 
 
 
484 aa  70.1  7e-11  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  29.45 
 
 
449 aa  70.1  7e-11  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  31.4 
 
 
477 aa  68.2  3e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  25.2 
 
 
503 aa  67.8  3e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  29.18 
 
 
401 aa  66.6  7e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0751  helix-turn-helix domain protein  26.54 
 
 
414 aa  66.6  7e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6698  transcriptional regulator, XRE family  27.73 
 
 
412 aa  66.2  9e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142695 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 
397 aa  64.3  4e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  28.63 
 
 
449 aa  63.5  6e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  35.88 
 
 
468 aa  63.5  7e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0917  hypothetical protein  26.45 
 
 
342 aa  60.8  4e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  27.92 
 
 
503 aa  60.5  5e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  24.52 
 
 
457 aa  59.7  9e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 
429 aa  58.5  2e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  25.99 
 
 
488 aa  57.4  4e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  29.23 
 
 
432 aa  57.4  5e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  3.76274e-09 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  26.74 
 
 
478 aa  55.1  2e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6440  hypothetical protein  29.82 
 
 
311 aa  52.4  1e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1672  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 
442 aa  52.8  1e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000955969  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4489  hypothetical protein  27.24 
 
 
440 aa  51.6  3e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.718463  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  25.19 
 
 
461 aa  50.1  7e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  27.78 
 
 
433 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  33.33 
 
 
579 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  26.75 
 
 
507 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0952  hypothetical protein  39.47 
 
 
444 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  30 
 
 
453 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  27.11 
 
 
467 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  26.87 
 
 
449 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4891  hypothetical protein  36.59 
 
 
444 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  24.29 
 
 
487 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  27.94 
 
 
452 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  27.22 
 
 
457 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>