More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3984 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 505 aa  1054    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  90.38 
 
 		 496 aa  955    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  57.23 
 
 		 504 aa  599  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  57.46 
 
 		 708 aa  595  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  55.07 
 
 		 508 aa  559  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  56.11 
 
 		 492 aa  560  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  54.94 
 
 		 503 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  53.88 
 
 		 508 aa  548  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  50.75 
 
 		 504 aa  462  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  50.21 
 
 		 505 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  45.47 
 
 		 499 aa  450  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  46.45 
 
 		 498 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  46.2 
 
 		 496 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  45.47 
 
 		 499 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  46.65 
 
 		 498 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  46.09 
 
 		 500 aa  431  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  40.28 
 
 		 495 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  39.92 
 
 		 505 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  39.38 
 
 		 587 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  38.36 
 
 		 568 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  38.74 
 
 		 574 aa  332  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  38.77 
 
 		 574 aa  331  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  40 
 
 		 574 aa  327  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  37.57 
 
 		 633 aa  325  9e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  35.66 
 
 		 523 aa  316  7e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  35.66 
 
 		 508 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  38.68 
 
 		 585 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  37.25 
 
 		 511 aa  308  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  39 
 
 		 814 aa  299  8e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  40.08 
 
 		 808 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  33.66 
 
 		 495 aa  295  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  35.04 
 
 		 522 aa  293  6e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  33.99 
 
 		 501 aa  290  4e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  35.02 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  34.03 
 
 		 523 aa  288  2e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  35.47 
 
 		 527 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  36.06 
 
 		 506 aa  280  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  34.84 
 
 		 493 aa  278  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  37.37 
 
 		 822 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  34.22 
 
 		 523 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  36.75 
 
 		 527 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  37.01 
 
 		 815 aa  276  8e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  34.5 
 
 		 860 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  33.46 
 
 		 505 aa  273  5.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  37.94 
 
 		 816 aa  273  5.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  33.93 
 
 		 494 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  35.9 
 
 		 513 aa  270  4e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  34.1 
 
 		 809 aa  265  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  35.17 
 
 		 516 aa  262  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  35.61 
 
 		 526 aa  262  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  34.23 
 
 		 499 aa  262  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  34.76 
 
 		 522 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  32.92 
 
 		 808 aa  257  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  34.24 
 
 		 799 aa  256  5e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  34.36 
 
 		 522 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  32.45 
 
 		 527 aa  256  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  34.17 
 
 		 799 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  30.75 
 
 		 526 aa  254  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  36.94 
 
 		 824 aa  253  6e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0333  N-6 DNA methylase  31.69 
 
 		 547 aa  252  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175232 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  32.99 
 
 		 814 aa  250  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  32.76 
 
 		 520 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  34.43 
 
 		 827 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  32.76 
 
 		 520 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  32.57 
 
 		 810 aa  248  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  36.25 
 
 		 908 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  33.2 
 
 		 871 aa  246  6e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  31.39 
 
 		 547 aa  246  6e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  34.2 
 
 		 891 aa  246  6.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  33.95 
 
 		 810 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  32.29 
 
 		 847 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  36.18 
 
 		 873 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  35.25 
 
 		 610 aa  240  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1177  XRE family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 519 aa  237  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.602323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  32.32 
 
 		 510 aa  236  8e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2925  N-6 DNA methylase  34.25 
 
 		 680 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  33.4 
 
 		 814 aa  233  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1565  N-6 DNA methylase  34.1 
 
 		 519 aa  232  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236926  unclonable  0.0000184799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  34.69 
 
 		 523 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  31.53 
 
 		 503 aa  220  5e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  30.56 
 
 		 520 aa  219  7e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  33.18 
 
 		 540 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.68 
 
 		 538 aa  216  7e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  30.81 
 
 		 537 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  30.81 
 
 		 537 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  31.41 
 
 		 518 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  30.31 
 
 		 547 aa  214  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  30 
 
 		 544 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  31.41 
 
 		 518 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  32.52 
 
 		 535 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  33.64 
 
 		 528 aa  213  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  33.64 
 
 		 517 aa  213  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  32.14 
 
 		 518 aa  212  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0753  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  32.08 
 
 		 534 aa  212  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  32.56 
 
 		 519 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  31.02 
 
 		 518 aa  210  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  31.02 
 
 		 518 aa  210  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  34.19 
 
 		 498 aa  210  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32.62 
 
 		 497 aa  210  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.66 
 
 		 549 aa  209  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>