17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3982 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3982  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2921  hypothetical protein  63.73 
 
 		 210 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.525203  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1884  hypothetical protein  59.2 
 
 		 217 aa  245  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0890  hypothetical protein  51.89 
 
 		 218 aa  224  8e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0784  hypothetical protein  51.15 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1184  hypothetical protein  30 
 
 		 323 aa  54.7  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000411873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1511  hypothetical protein  27.73 
 
 		 347 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2826  hypothetical protein  28.89 
 
 		 342 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.551029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1185  hypothetical protein  26.98 
 
 		 389 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0012154  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0585  hypothetical protein  40.38 
 
 		 419 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0519  hypothetical protein  22.75 
 
 		 394 aa  47.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  31.91 
 
 		 1150 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  28.97 
 
 		 1427 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0051  hypothetical protein  36.23 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4772  hypothetical protein  28.72 
 
 		 346 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  35.53 
 
 		 2216 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7458  hypothetical protein  29 
 
 		 373 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0297614  normal  0.563614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>