More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3953 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
701 aa  1438    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  51.26 
 
 
706 aa  722    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  89.71 
 
 
690 aa  1281    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  86.06 
 
 
703 aa  1252    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  69.8 
 
 
710 aa  1028    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  69.82 
 
 
712 aa  1021    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  86.97 
 
 
706 aa  1275    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  87.82 
 
 
706 aa  1284    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  87.82 
 
 
706 aa  1285    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  65.06 
 
 
697 aa  956    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  83.76 
 
 
702 aa  1231    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  70.62 
 
 
714 aa  1053    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  71.41 
 
 
712 aa  1024    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  82.1 
 
 
709 aa  1203    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  81.54 
 
 
709 aa  1197    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4042  TonB-dependent siderophore receptor  80.8 
 
 
697 aa  1196    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296308  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06761  hypothetical protein  44.62 
 
 
690 aa  569  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000849  putative ferrichrome-iron receptor  43.36 
 
 
699 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.744816  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  38.5 
 
 
693 aa  479  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  36.89 
 
 
693 aa  435  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  31.05 
 
 
710 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 
710 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 
770 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 
738 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 
706 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 
706 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 
737 aa  218  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 
748 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 
749 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 
748 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 
742 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 
742 aa  213  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 
860 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 
740 aa  210  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 
743 aa  208  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 
721 aa  208  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  26.75 
 
 
795 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  26.89 
 
 
795 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 
707 aa  204  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 
757 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 
709 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 
694 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  26.82 
 
 
796 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 
719 aa  200  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 
707 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.12 
 
 
724 aa  199  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  26.82 
 
 
708 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 
715 aa  197  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 
796 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 
796 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 
726 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 
792 aa  196  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  26.78 
 
 
695 aa  195  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 
711 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 
726 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 
850 aa  195  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 
743 aa  194  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.39 
 
 
711 aa  193  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 
796 aa  193  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  27.2 
 
 
815 aa  193  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.73 
 
 
709 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 
726 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 
764 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 
710 aa  190  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  24.86 
 
 
708 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 
863 aa  188  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 
708 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 
864 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  25.21 
 
 
703 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  28.63 
 
 
713 aa  187  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 
809 aa  187  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 
701 aa  187  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 
700 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 
701 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  26.3 
 
 
689 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 
698 aa  185  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  28.35 
 
 
713 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 
817 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 
791 aa  185  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  27.47 
 
 
715 aa  184  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 
701 aa  184  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 
714 aa  183  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 
710 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  27.06 
 
 
708 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 
742 aa  183  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 
742 aa  183  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 
698 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  26.76 
 
 
791 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 
719 aa  182  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.79 
 
 
696 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 
677 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 
714 aa  182  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  27.37 
 
 
703 aa  181  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 
696 aa  180  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  26.45 
 
 
855 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  26.45 
 
 
855 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 
701 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  26.73 
 
 
713 aa  179  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 
701 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 
810 aa  179  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>