More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3897 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  93.95 
 
 		 347 aa  677    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 347 aa  717    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  93.66 
 
 		 347 aa  677    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  93.66 
 
 		 347 aa  674    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  94.46 
 
 		 354 aa  674    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  87.79 
 
 		 347 aa  632  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  87.83 
 
 		 340 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  87.24 
 
 		 340 aa  618  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  87.24 
 
 		 340 aa  620  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  79.06 
 
 		 347 aa  566  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  77.84 
 
 		 359 aa  565  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  74.34 
 
 		 359 aa  549  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  78.47 
 
 		 342 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  74.13 
 
 		 343 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  74.63 
 
 		 348 aa  525  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  73.53 
 
 		 350 aa  519  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  57.76 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  51.61 
 
 		 373 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  51.61 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  54.71 
 
 		 347 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  56.06 
 
 		 334 aa  352  4e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  46.7 
 
 		 357 aa  335  5e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  46.47 
 
 		 351 aa  309  5.9999999999999995e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001811  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  46.87 
 
 		 340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  44.21 
 
 		 374 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2806  glycosyl transferase family protein  42.99 
 
 		 362 aa  293  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629835 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  43.66 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  41.06 
 
 		 336 aa  255  8e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  40.48 
 
 		 349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  39.13 
 
 		 349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0849  glycosyl transferase family 9  40.42 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0016  glycosyl transferase family protein  39.53 
 
 		 357 aa  249  7e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1293  glycosyl transferase family protein  39.4 
 
 		 350 aa  248  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1358  saccharide biosynthesis regulatory protein  39.1 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02452  heptosyl transferase, glycosyltransferase family 9 protein  40.06 
 
 		 340 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  36.49 
 
 		 351 aa  232  6e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  36.49 
 
 		 351 aa  232  7.000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  29.19 
 
 		 779 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2728  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 316 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  0.174728 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  25.16 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.47 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.51 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.5 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  27.59 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.95 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.87 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.06 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.75 
 
 		 360 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.87 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  25.18 
 
 		 330 aa  95.9  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1703  glycosyl transferase family 9  27.05 
 
 		 325 aa  96.3  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.17 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2729  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.19 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.64 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.29 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.29 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.29 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  26.54 
 
 		 458 aa  90.9  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.29 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.29 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.59 
 
 		 340 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.59 
 
 		 340 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  22.59 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  26.73 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.38 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  24.1 
 
 		 370 aa  87.4  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4092  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.22 
 
 		 340 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.74 
 
 		 394 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  33.54 
 
 		 334 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0589  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.96 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253987  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2764  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  25.17 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.41 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.41 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.41 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.41 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0601  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.93 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.41 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.41 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  27.44 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  26.87 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.26 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.42 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  21.45 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1046  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.92 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.41 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1490  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.04 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863183  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0642  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.62 
 
 		 332 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1808  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.81 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.17 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.6 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727875  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.4 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.4 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>