More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3871 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  87.12 
 
 
396 aa  728    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  89.65 
 
 
394 aa  741    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  85.86 
 
 
396 aa  717    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  87.88 
 
 
396 aa  734    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  87.88 
 
 
411 aa  733    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  77.02 
 
 
392 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  87.63 
 
 
396 aa  731    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  87.63 
 
 
411 aa  732    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  88.64 
 
 
396 aa  739    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  76.25 
 
 
398 aa  637    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
396 aa  813    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  73.63 
 
 
400 aa  630  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  73.12 
 
 
397 aa  615  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  71.21 
 
 
392 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  70.78 
 
 
401 aa  600  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  71.21 
 
 
394 aa  590  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  62.31 
 
 
405 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  58.54 
 
 
403 aa  488  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  39.67 
 
 
386 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  37.78 
 
 
402 aa  282  7.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  37.86 
 
 
389 aa  272  6e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  37.76 
 
 
388 aa  270  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  35.43 
 
 
410 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  38.35 
 
 
398 aa  259  6e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  37.02 
 
 
400 aa  256  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  37.12 
 
 
401 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  36.68 
 
 
390 aa  252  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  36.89 
 
 
391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  35.55 
 
 
424 aa  239  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  34.58 
 
 
405 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  36.1 
 
 
417 aa  237  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  32.79 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  32.04 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  31.58 
 
 
401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  32.51 
 
 
393 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  33.24 
 
 
404 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  34.55 
 
 
412 aa  209  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  33.73 
 
 
413 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  32.29 
 
 
377 aa  208  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  32.96 
 
 
439 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  32.21 
 
 
406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  31.4 
 
 
427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 
419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  30.71 
 
 
402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  30.65 
 
 
414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  32.42 
 
 
436 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  32.05 
 
 
410 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  33.73 
 
 
402 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 
399 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  35.58 
 
 
446 aa  193  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
403 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  31.7 
 
 
406 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 
411 aa  190  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  30.2 
 
 
401 aa  189  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  32.11 
 
 
409 aa  189  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  36.67 
 
 
364 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  30.63 
 
 
404 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 
413 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  37.34 
 
 
350 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  31.54 
 
 
403 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 
431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  30.13 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  35.45 
 
 
448 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  28.61 
 
 
395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 
373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  29.5 
 
 
419 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  31.34 
 
 
402 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  31.86 
 
 
389 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.95 
 
 
390 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  32.44 
 
 
424 aa  176  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  32.3 
 
 
364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  35.07 
 
 
448 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  32.68 
 
 
373 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  33.69 
 
 
441 aa  170  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  29.18 
 
 
369 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  34.87 
 
 
370 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  32.09 
 
 
419 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  29.02 
 
 
395 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  32.76 
 
 
372 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  30.55 
 
 
366 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  36.29 
 
 
360 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  28.78 
 
 
345 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  26.99 
 
 
488 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  33.6 
 
 
350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3124  metal dependent phosphohydrolase  33.44 
 
 
341 aa  153  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  29.97 
 
 
304 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0497  metal dependent phosphohydrolase  32.01 
 
 
349 aa  153  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  32.96 
 
 
356 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0132  metal dependent phosphohydrolase  31.7 
 
 
457 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251031  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  28.53 
 
 
369 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  32.49 
 
 
346 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  30.45 
 
 
352 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 
362 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  28.05 
 
 
372 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 
356 aa  149  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  30.33 
 
 
349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  28.39 
 
 
304 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3058  metal dependent phosphohydrolase  30.19 
 
 
352 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  27.44 
 
 
435 aa  144  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>