298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3865 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 
300 aa  597  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  87 
 
 
300 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  85.67 
 
 
300 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  87 
 
 
300 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  86.67 
 
 
300 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  66.67 
 
 
303 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  64.21 
 
 
311 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  64.55 
 
 
311 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  63.55 
 
 
310 aa  384  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5121  homocysteine S-methyltransferase  65.22 
 
 
299 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0135376  normal  0.478948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1135  homocysteine S-methyltransferase family protein  61.87 
 
 
298 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0975  homocysteine S-methyltransferase  62.21 
 
 
310 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000866621  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2776  homocysteine S-methyltransferase family protein  59.08 
 
 
307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  58.67 
 
 
308 aa  315  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  55.67 
 
 
309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  52.03 
 
 
302 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  56.7 
 
 
309 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  52.7 
 
 
301 aa  289  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6804  homocysteine S-methyltransferase  54.73 
 
 
313 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  49.34 
 
 
305 aa  287  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3747  homocysteine S-methyltransferase  56.55 
 
 
302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  51.69 
 
 
302 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  50.68 
 
 
310 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  43.14 
 
 
301 aa  236  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48307  predicted protein  38.99 
 
 
346 aa  189  7e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  39.2 
 
 
304 aa  188  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  38.64 
 
 
305 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  34.78 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3928  homocysteine S-methyltransferase  34.45 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.45742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  34.31 
 
 
307 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  32.92 
 
 
316 aa  99  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  30.12 
 
 
311 aa  96.3  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  32.59 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  31.37 
 
 
311 aa  93.2  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  31.33 
 
 
325 aa  93.2  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  32.91 
 
 
310 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  32.81 
 
 
313 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.92 
 
 
605 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  31.33 
 
 
816 aa  87.8  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  32.37 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  31.17 
 
 
295 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  30.41 
 
 
312 aa  85.9  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  28.25 
 
 
800 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  29.56 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  28.75 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  28.48 
 
 
1223 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  29.71 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  31.15 
 
 
578 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  30.07 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.1 
 
 
609 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  30.84 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  28.12 
 
 
1215 aa  76.3  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  24.6 
 
 
780 aa  75.1  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  26.23 
 
 
807 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1524  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.9 
 
 
615 aa  72.8  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  24.55 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1670  homocysteine S-methyltransferase family protein  25.25 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0295  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.37 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  29.94 
 
 
804 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0149  homocysteine S-methyltransferase  25.37 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  24.18 
 
 
774 aa  67.8  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0118  methionine synthase (B12-dependent)  26.55 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  31.43 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  33.12 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2048  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.97 
 
 
614 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  28.8 
 
 
801 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  30.13 
 
 
841 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  31.21 
 
 
806 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  24.85 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  28.3 
 
 
839 aa  67  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0156  homocysteine S-methyltransferase  25.37 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  32 
 
 
615 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  30.27 
 
 
818 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1406  homocysteine S-methyltransferase, putative  24.01 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  28.39 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2974  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.3 
 
 
605 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.15 
 
 
1226 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1750  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  22.55 
 
 
598 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  26.35 
 
 
804 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.91 
 
 
616 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0266464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0839  homocysteine S-methyltransferase  23.95 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  24.05 
 
 
1224 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  28.92 
 
 
1158 aa  64.7  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  25.16 
 
 
1191 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.62 
 
 
617 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  23.75 
 
 
791 aa  63.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  28.12 
 
 
803 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  23.68 
 
 
1163 aa  61.6  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  25.51 
 
 
629 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  30.06 
 
 
813 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  26.76 
 
 
1158 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  23.55 
 
 
1176 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  26.82 
 
 
819 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0087  methionine synthase (B12-dependent)  26.3 
 
 
355 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.398145  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  25.08 
 
 
1212 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  27.66 
 
 
1171 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  30.62 
 
 
804 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  24.5 
 
 
768 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2931  homocysteine S-methyltransferase  26.92 
 
 
355 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2302  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  26.92 
 
 
355 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>