126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3778 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  92.51 
 
 
414 aa  767    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  93.54 
 
 
418 aa  788    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  80.1 
 
 
417 aa  684    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  90.67 
 
 
418 aa  767    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  90.43 
 
 
418 aa  765    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  82.3 
 
 
418 aa  692    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  91.15 
 
 
418 aa  769    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  93.3 
 
 
418 aa  786    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  78.9 
 
 
418 aa  656    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  100 
 
 
418 aa  829    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  93.3 
 
 
418 aa  787    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  79.86 
 
 
418 aa  661    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  78.66 
 
 
418 aa  652    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  93.54 
 
 
418 aa  788    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  80.1 
 
 
418 aa  674    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  77.03 
 
 
418 aa  634  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  61.18 
 
 
467 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  59.9 
 
 
417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  54.92 
 
 
425 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3466  tryptophan permease  58.66 
 
 
414 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4480  tryptophan permease  58.14 
 
 
414 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3466  tryptophan permease  58.4 
 
 
414 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3598  tryptophan permease  58.4 
 
 
414 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3457  tryptophan permease  58.14 
 
 
414 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.813995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03028  tryptophan transporter of high affinity  57.88 
 
 
414 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0544  aromatic amino acid transporter  58.14 
 
 
414 aa  434  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02979  hypothetical protein  57.88 
 
 
414 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3353  tryptophan permease  57.88 
 
 
414 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3643  tryptophan permease  57.88 
 
 
414 aa  433  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  53.66 
 
 
414 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  52.3 
 
 
414 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0537  tryptophan permease  57.88 
 
 
414 aa  433  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0411186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3611  tryptophan permease  57.88 
 
 
414 aa  434  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3535  tryptophan permease  57.36 
 
 
414 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3572  tryptophan permease  57.36 
 
 
414 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3634  tryptophan permease  57.11 
 
 
414 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  54.27 
 
 
424 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  54.44 
 
 
424 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  51.82 
 
 
414 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  52.06 
 
 
412 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  50.61 
 
 
416 aa  395  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  49.76 
 
 
419 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03593  tryptophan transporter of low affinity  47.17 
 
 
415 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03537  hypothetical protein  47.17 
 
 
415 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3923  tryptophan permease TnaB  47.17 
 
 
415 aa  360  3e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4218  tryptophan permease TnaB  47.17 
 
 
415 aa  360  3e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4258  aromatic amino acid transporter  46.68 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4285  tryptophan permease TnaB  46.68 
 
 
415 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5140  tryptophan permease TnaB  46.93 
 
 
415 aa  356  5e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4213  tryptophan permease TnaB  46.93 
 
 
413 aa  353  4e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  45.02 
 
 
409 aa  348  9e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0800  tryptophan permease  43.46 
 
 
409 aa  306  7e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.121788  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1118  tryptophan-specific transport protein  43.07 
 
 
411 aa  291  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  37.75 
 
 
403 aa  255  8e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  37.32 
 
 
403 aa  253  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  37.32 
 
 
403 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  37.75 
 
 
403 aa  253  7e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  37.32 
 
 
403 aa  252  7e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  37.75 
 
 
403 aa  253  7e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  37.75 
 
 
403 aa  253  7e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  37.75 
 
 
403 aa  253  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  37.75 
 
 
403 aa  253  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  36.07 
 
 
422 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  37.35 
 
 
402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  35.82 
 
 
422 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  35.57 
 
 
422 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  35.57 
 
 
422 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  35.57 
 
 
422 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  34.84 
 
 
400 aa  239  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  37.38 
 
 
402 aa  236  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  38.28 
 
 
402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  38.28 
 
 
402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  38.28 
 
 
402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  36.34 
 
 
400 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  34.02 
 
 
395 aa  226  9e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  34.02 
 
 
395 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  33.76 
 
 
395 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  34.97 
 
 
395 aa  224  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  33.5 
 
 
395 aa  223  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  33.76 
 
 
395 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  34.97 
 
 
395 aa  222  9e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  34.52 
 
 
395 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  37.09 
 
 
402 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  34.97 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  33.58 
 
 
400 aa  220  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  35.99 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  34.81 
 
 
400 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  36.55 
 
 
388 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  33.42 
 
 
400 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  32.63 
 
 
395 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  33.42 
 
 
399 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  31.46 
 
 
380 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  31.67 
 
 
390 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  32.92 
 
 
403 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  31.47 
 
 
391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  32.39 
 
 
392 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  32.8 
 
 
361 aa  186  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0916  aromatic amino acid permease  34.13 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3389  aromatic amino acid permease  32.47 
 
 
395 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3465  aromatic amino acid permease  32.38 
 
 
391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>