199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3656 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
202 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  86.17 
 
 
202 aa  351  5e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  84.65 
 
 
203 aa  341  4e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  86.63 
 
 
202 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  86.63 
 
 
202 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  82.98 
 
 
203 aa  339  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  82.98 
 
 
203 aa  339  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  86.63 
 
 
202 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  86.63 
 
 
202 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  78.39 
 
 
203 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  79.9 
 
 
203 aa  318  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  78.22 
 
 
204 aa  317  9e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  77.39 
 
 
203 aa  316  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  77.23 
 
 
203 aa  307  8e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  79.4 
 
 
205 aa  304  6e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  74.63 
 
 
203 aa  300  8.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.08 
 
 
202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.71 
 
 
200 aa  168  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  42.71 
 
 
200 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  39.7 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.21 
 
 
211 aa  159  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.39 
 
 
210 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  40 
 
 
200 aa  153  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  37.13 
 
 
207 aa  152  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 
250 aa  151  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  34.42 
 
 
250 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  34.42 
 
 
250 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 
250 aa  150  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  40.66 
 
 
199 aa  149  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  39.89 
 
 
208 aa  145  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  39.89 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  39.89 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  39.89 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  39.89 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  39.89 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  39.89 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  39.89 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  39.89 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  33.49 
 
 
250 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.14 
 
 
207 aa  141  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 
251 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 
251 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 
251 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  42.08 
 
 
207 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  42.08 
 
 
207 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  42.08 
 
 
207 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  42.08 
 
 
207 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  42.08 
 
 
207 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  36.84 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  36.84 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0796  DSBA oxidoreductase  31.19 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  36.84 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  40 
 
 
207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  32.24 
 
 
249 aa  139  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 
251 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.03 
 
 
207 aa  138  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  39.47 
 
 
207 aa  138  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.95 
 
 
207 aa  136  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  39.34 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  36.06 
 
 
207 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3441  DSBA oxidoreductase  31.31 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0818  DSBA oxidoreductase  30.88 
 
 
218 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0686  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 
220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.355761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  41.28 
 
 
214 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  33.33 
 
 
248 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.9 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0308  protein disulfide-isomerase (thiol:disulfide interchange protein)  36.63 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  35.64 
 
 
207 aa  105  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.5 
 
 
216 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  35.12 
 
 
207 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  35.47 
 
 
207 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0983  DSBA oxidoreductase  32.35 
 
 
213 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 
220 aa  101  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  35.12 
 
 
217 aa  101  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  37.23 
 
 
275 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4675  thiol:disulfide interchange protein DsbA  35.91 
 
 
219 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.5 
 
 
211 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0234  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  33.33 
 
 
202 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.92 
 
 
211 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  34.17 
 
 
210 aa  98.6  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 
206 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 
206 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 
216 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  31.19 
 
 
210 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  30.69 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  29.7 
 
 
214 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 
206 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3379  disulfide isomerase  32.72 
 
 
223 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.996727 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3444  disulfide isomerase  32.72 
 
 
223 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.923354  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3546  disulfide isomerase  32.72 
 
 
223 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.504028 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3374  disulfide isomerase  32.72 
 
 
223 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3451  disulfide isomerase  32.72 
 
 
223 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  30.89 
 
 
293 aa  91.7  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  35.12 
 
 
204 aa  91.3  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.7 
 
 
214 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 
210 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3334  DsbA family thioredoxin  31.8 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>