More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3567 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  53.36 
 
 		 686 aa  675    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  52.91 
 
 		 686 aa  670    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  93.75 
 
 		 704 aa  1332    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  82.88 
 
 		 710 aa  1178    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  57.78 
 
 		 697 aa  773    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  95.45 
 
 		 704 aa  1347    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  82.65 
 
 		 714 aa  1181    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  53.36 
 
 		 686 aa  675    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  91.78 
 
 		 706 aa  1301    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  100 
 
 		 703 aa  1423    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3619  general secretion pathway protein D  83.38 
 
 		 707 aa  1178    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  53.21 
 
 		 686 aa  672    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  55.32 
 
 		 672 aa  726    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  81.61 
 
 		 703 aa  1152    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  57.06 
 
 		 681 aa  773    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  57.36 
 
 		 675 aa  759    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  55.21 
 
 		 658 aa  718    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  81.86 
 
 		 705 aa  1157    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  53.36 
 
 		 686 aa  675    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2306  general secretion pathway protein D  54.86 
 
 		 674 aa  707    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  91.21 
 
 		 705 aa  1291    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  53.59 
 
 		 662 aa  701    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  56.08 
 
 		 689 aa  753    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  82.91 
 
 		 724 aa  1189    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  93.87 
 
 		 700 aa  1320    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  93.87 
 
 		 700 aa  1320    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  91.35 
 
 		 705 aa  1293    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  81.56 
 
 		 710 aa  1159    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  96.01 
 
 		 702 aa  1354    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  50 
 
 		 640 aa  600  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  49.68 
 
 		 640 aa  596  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  48.63 
 
 		 655 aa  567  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  45.11 
 
 		 650 aa  549  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  44.96 
 
 		 654 aa  548  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  44.88 
 
 		 654 aa  547  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  44.44 
 
 		 660 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  40.13 
 
 		 640 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  40.13 
 
 		 640 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  39.97 
 
 		 640 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  37.74 
 
 		 655 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  36.92 
 
 		 673 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  34.94 
 
 		 670 aa  390  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3580  helix-turn-helix, AraC type  35.04 
 
 		 666 aa  349  8e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18181  normal  0.716334 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  34.95 
 
 		 645 aa  341  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1470  general secretion pathway protein D  57.72 
 
 		 714 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0381  general secretion pathway protein D  35.73 
 
 		 650 aa  338  2.9999999999999997e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.693227  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  36.77 
 
 		 634 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  35.6 
 
 		 658 aa  334  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  35.11 
 
 		 658 aa  333  8e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0141  general secretion pathway protein D  36.18 
 
 		 725 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  35.16 
 
 		 703 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  33.81 
 
 		 776 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  31.81 
 
 		 696 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4180  general secretion pathway protein D  36.75 
 
 		 650 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  56.27 
 
 		 716 aa  320  7.999999999999999e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  33.23 
 
 		 748 aa  319  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  33.07 
 
 		 758 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  34.73 
 
 		 649 aa  307  5.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  33.48 
 
 		 750 aa  306  9.000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  32.57 
 
 		 740 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  30.95 
 
 		 738 aa  278  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  32.33 
 
 		 793 aa  276  9e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0315  type II and III secretion system protein  30.98 
 
 		 732 aa  275  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.713775 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1274  type II protein secretion LspD  29.77 
 
 		 791 aa  273  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1275  type II protein secretion LspD  29.77 
 
 		 791 aa  273  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  32.15 
 
 		 702 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  31.38 
 
 		 728 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  30.28 
 
 		 717 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  30.28 
 
 		 747 aa  266  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  31.73 
 
 		 736 aa  265  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  31.21 
 
 		 807 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  31.56 
 
 		 753 aa  262  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  32.05 
 
 		 803 aa  260  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  30.62 
 
 		 748 aa  259  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  31.08 
 
 		 799 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  30.73 
 
 		 641 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  30.34 
 
 		 635 aa  239  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  30.05 
 
 		 636 aa  234  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  31.35 
 
 		 632 aa  232  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1087  general secretion pathway protein D  37.14 
 
 		 584 aa  231  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.57571  normal  0.616621 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  29.97 
 
 		 630 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1046  general secretion pathway protein D  36.67 
 
 		 584 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.603917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  28.06 
 
 		 648 aa  226  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1043  general secretion pathway protein D  37.14 
 
 		 584 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.795547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  39.78 
 
 		 805 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  39.66 
 
 		 810 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  37.85 
 
 		 787 aa  214  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  39.23 
 
 		 783 aa  208  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  40.91 
 
 		 781 aa  207  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  39.4 
 
 		 777 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  39.4 
 
 		 771 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03176  general secretory pathway component, cryptic  48.19 
 
 		 338 aa  206  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  38.4 
 
 		 781 aa  206  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  38.07 
 
 		 682 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03127  hypothetical protein  48.19 
 
 		 338 aa  206  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0771412  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  38.11 
 
 		 781 aa  204  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  37.88 
 
 		 775 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0081  general secretion pathway protein D  39.46 
 
 		 780 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  36.97 
 
 		 783 aa  200  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0062  general secretion pathway protein D  37.71 
 
 		 774 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>