66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3535 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  100 
 
 
119 aa  247  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  79.83 
 
 
117 aa  203  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  78.99 
 
 
117 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  78.99 
 
 
117 aa  198  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  77.31 
 
 
117 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  78.15 
 
 
117 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  86 
 
 
101 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  86.73 
 
 
117 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  82.47 
 
 
117 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  50 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  51.38 
 
 
116 aa  124  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  38.89 
 
 
135 aa  90.9  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  39.68 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  40.48 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  42.06 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  44.44 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  35.94 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  38.98 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  33.06 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  36.04 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  33.33 
 
 
116 aa  67  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  39.74 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  34.78 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  34.07 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  33.9 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  31.3 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  41.46 
 
 
172 aa  60.1  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1413  tetraheme cytochrome c, putative  33.33 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  39.51 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  39.51 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0275  tetraheme cytochrome c, putative  33.73 
 
 
122 aa  57  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173309 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  32.38 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  26.67 
 
 
596 aa  57  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  26.89 
 
 
596 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  31.36 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0324  tetraheme cytochrome c, putative  30.11 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  34.07 
 
 
144 aa  53.9  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  32.98 
 
 
118 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  26.89 
 
 
596 aa  50.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  26.85 
 
 
118 aa  50.1  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  26.05 
 
 
596 aa  50.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  30.36 
 
 
588 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  28.21 
 
 
596 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  28.21 
 
 
596 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.21 
 
 
596 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  28.21 
 
 
596 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  28.21 
 
 
597 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  26.89 
 
 
596 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  26.89 
 
 
596 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  26.89 
 
 
596 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  26.89 
 
 
596 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.87 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  37.18 
 
 
153 aa  47  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  35.48 
 
 
589 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30.25 
 
 
593 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  37.97 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  36.47 
 
 
591 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  26.36 
 
 
583 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  28.35 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  35 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  30.19 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  32.05 
 
 
596 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.4 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0627  hypothetical protein  33.04 
 
 
125 aa  41.2  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.593343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.35 
 
 
589 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1005  hypothetical protein  43.64 
 
 
172 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.289863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>