111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3460 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3460  peptidoglycan hydrolase  100 
 
 
135 aa  276  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3963  peptidoglycan hydrolase  93.33 
 
 
135 aa  262  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3643  peptidoglycan hydrolase  67.15 
 
 
139 aa  175  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0067  peptidoglycan hydrolase  60.14 
 
 
140 aa  157  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0061  peptidoglycan hydrolase  60.14 
 
 
145 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000732  flagellar protein FlgJ  40.21 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04917  putative flagellar protein FlgJ  40.86 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02920  putative flagellar biosynthesis  44.44 
 
 
316 aa  73.9  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3570  putative flagellar protein FlgJ  41.56 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409838  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1505  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  42.39 
 
 
430 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2205  RelA/SpoT protein  45.21 
 
 
318 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50380  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38 
 
 
400 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0038351  hitchhiker  0.00140941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4292  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38 
 
 
400 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3363  rod binding protein-like protein  36.36 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0271  lateral flagellar peptidoglycan hydrolase LfgJ  36.36 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.697145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1943  peptidoglycan hydrolase FlgJ  45.21 
 
 
416 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0130803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3079  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  39.47 
 
 
337 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3241  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  42.11 
 
 
384 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1267  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  42.11 
 
 
384 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1337  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  42.11 
 
 
384 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.75524  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3472  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.84 
 
 
414 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.603408  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2939  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  42.11 
 
 
380 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1353  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
341 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2954  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  42.11 
 
 
380 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3092  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  42.11 
 
 
380 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1424  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  42.11 
 
 
380 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5633  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.08 
 
 
348 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1329  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.79 
 
 
389 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0311212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2589  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.79 
 
 
385 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1473  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.73 
 
 
384 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0415846  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1110  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.26 
 
 
328 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197589  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2842  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.23 
 
 
394 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.948004  normal  0.211592 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  29.51 
 
 
291 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.5 
 
 
291 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1605  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.16 
 
 
336 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202328  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4382  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.33 
 
 
384 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.834479 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3742  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.24 
 
 
340 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.412166  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3092  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  42.37 
 
 
269 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  36.78 
 
 
374 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1348  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
363 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3943  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.84 
 
 
384 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4191  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  42.17 
 
 
327 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2962  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.08 
 
 
318 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3723  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.84 
 
 
388 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1169  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.33 
 
 
377 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0546909  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1485  flagellar protein FlgJ  36.11 
 
 
379 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.477202  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0219  peptidoglycan hydrolase  32.26 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2310  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.87 
 
 
372 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0647  peptidoglycan hydrolase  31.91 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1533  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.97 
 
 
325 aa  50.8  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3575  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.21 
 
 
328 aa  50.4  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2006  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.27 
 
 
314 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3786  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.46 
 
 
332 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392449  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004165  flagellar protein FlgJ  30.77 
 
 
307 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1784  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.63 
 
 
312 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2316  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.27 
 
 
314 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2417  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.27 
 
 
314 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112491  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1768  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.8 
 
 
353 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.917503  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2916  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.1 
 
 
352 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.110406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2622  hypothetical protein  30.95 
 
 
116 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00105053  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01295  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  29.25 
 
 
308 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1876  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36 
 
 
320 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.803787  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  35.53 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1311  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31 
 
 
367 aa  47.4  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01004  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.78 
 
 
392 aa  47  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06162  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.78 
 
 
392 aa  47  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0248  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.54 
 
 
310 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2590  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.06 
 
 
320 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01077  flagellar biosynthesis protein FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2565  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112563  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0757  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  37.35 
 
 
324 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01085  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.188745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1595  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.48 
 
 
317 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1204  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0662676  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1204  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.592055  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3012  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.18 
 
 
319 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2519  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2047  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.277131  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1460  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.969398  hitchhiker  0.0000147806 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2003  flagellar protein FlgJ  28.07 
 
 
560 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1629  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  37.04 
 
 
294 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.610311 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0598  Flagellar protein FlgJ-like protein  33.33 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  29.36 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24080  flagellar rod assembly protein/muramidase  38.46 
 
 
325 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337249  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2370  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.15 
 
 
325 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1466  flagellar biosynthesis  31.58 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0901  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.18 
 
 
371 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.337288  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1898  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.88 
 
 
399 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  27.03 
 
 
605 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3333  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.84 
 
 
311 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0471  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.84 
 
 
311 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  27.88 
 
 
388 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2091  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.84 
 
 
311 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0274  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.84 
 
 
311 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.659394  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0286  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.84 
 
 
311 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3346  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.84 
 
 
311 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1279  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.56 
 
 
316 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.814453  hitchhiker  0.00560108 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0934  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.76 
 
 
351 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1250  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.56 
 
 
316 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.379236 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2006  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.56 
 
 
316 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00375392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>