220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3454 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 
448 aa  913    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  91.52 
 
 
448 aa  815    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  62.72 
 
 
448 aa  578  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  57.11 
 
 
458 aa  525  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  52.22 
 
 
472 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  31.46 
 
 
445 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  29.91 
 
 
437 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.86 
 
 
431 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.79 
 
 
447 aa  152  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.57 
 
 
451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.57 
 
 
455 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  28.26 
 
 
445 aa  143  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  26.93 
 
 
438 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  27.71 
 
 
458 aa  141  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.78 
 
 
473 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.56 
 
 
475 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.11 
 
 
500 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.27 
 
 
438 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.2 
 
 
453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  27.29 
 
 
466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.51 
 
 
477 aa  133  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.65 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.9 
 
 
505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  25 
 
 
505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.47 
 
 
468 aa  131  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  26.79 
 
 
466 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  28.9 
 
 
441 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  28.16 
 
 
474 aa  131  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  26.55 
 
 
454 aa  130  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  27.46 
 
 
472 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  26.53 
 
 
466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.14 
 
 
456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  26.55 
 
 
456 aa  127  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  29.45 
 
 
468 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  28.2 
 
 
477 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.1 
 
 
502 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.33 
 
 
475 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  29.45 
 
 
468 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.19 
 
 
502 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.39 
 
 
456 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  25.1 
 
 
502 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.1 
 
 
502 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.63 
 
 
487 aa  123  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3586  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.49 
 
 
447 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  28.61 
 
 
781 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.05 
 
 
657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  25.27 
 
 
500 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  25 
 
 
458 aa  121  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  27.18 
 
 
474 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  28.04 
 
 
677 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.22 
 
 
465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  27.09 
 
 
467 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  27.09 
 
 
467 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  27.09 
 
 
467 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  27.34 
 
 
471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.38 
 
 
457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0655  flagellar hook-associated protein 2  27.23 
 
 
428 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.27 
 
 
457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  26.27 
 
 
454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25 
 
 
454 aa  114  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  27.86 
 
 
685 aa  113  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  25.51 
 
 
513 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.6 
 
 
472 aa  113  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  24.9 
 
 
504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.9 
 
 
504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  25.92 
 
 
469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0207  flagellar hook-associated protein 2  26.73 
 
 
425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.547733 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  28.03 
 
 
468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  25.31 
 
 
507 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  27.86 
 
 
465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  28.03 
 
 
468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  26.8 
 
 
668 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  28.03 
 
 
468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  25.31 
 
 
507 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  25.31 
 
 
507 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  25.31 
 
 
507 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  25.31 
 
 
507 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  25.31 
 
 
507 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.78 
 
 
468 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.45 
 
 
454 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.53 
 
 
470 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.62 
 
 
476 aa  110  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.87 
 
 
448 aa  110  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  25.1 
 
 
507 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  28.03 
 
 
468 aa  109  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  24.49 
 
 
478 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  27.36 
 
 
471 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.52 
 
 
499 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.24 
 
 
454 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  26.69 
 
 
487 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.52 
 
 
456 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3083  flagellar hook-associated 2-like  24.02 
 
 
486 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.75 
 
 
457 aa  107  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.36 
 
 
504 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.24 
 
 
449 aa  106  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0092  flagellar hook-associated protein  27.52 
 
 
506 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.68 
 
 
680 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.75 
 
 
482 aa  106  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.68 
 
 
680 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3871  flagellar hook-associated protein  27.52 
 
 
506 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>