65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3451 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3451  flagellar hook-length control protein  100 
 
 
393 aa  793  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3952  flagellar hook-length control protein  69.17 
 
 
395 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253491  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0059  flagellar hook-length control protein  47.42 
 
 
390 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0053  hypothetical protein  53.37 
 
 
383 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3635  flagellar hook-length control protein  52.15 
 
 
438 aa  174  2e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.225852  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04953  flagellar hook-length control protein  38.24 
 
 
351 aa  90.1  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001169  flagellar hook-length control protein FliK  37.96 
 
 
357 aa  84.3  3e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.272814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3583  flagellar hook-length control protein  31.58 
 
 
334 aa  72.4  1e-11  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0189  flagellar hook-length control protein  35.38 
 
 
352 aa  66.6  6e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511537  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  33.86 
 
 
568 aa  65.5  1e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  36.36 
 
 
512 aa  64.7  3e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1964  Flagellar hook-length control protein-like protein  30.34 
 
 
324 aa  62.4  1e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  30.88 
 
 
527 aa  62.4  1e-08  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  35.2 
 
 
491 aa  60.5  5e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  36.36 
 
 
579 aa  60.5  5e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  36.36 
 
 
585 aa  60.5  5e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0204  flagellar hook-length control protein  36.14 
 
 
361 aa  60.5  6e-08  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.504865 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0658  flagellar hook-length control protein  34.94 
 
 
365 aa  60.1  7e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  36.36 
 
 
586 aa  59.7  9e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0493  flagellar hook-length control protein  37.5 
 
 
460 aa  57  5e-07  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3888  hypothetical protein  36 
 
 
428 aa  57  6e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45830  hypothetical protein  36 
 
 
427 aa  56.6  7e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2931  flagellar hook-length control protein  38.36 
 
 
717 aa  56.6  8e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2921  flagellar hook-length control protein  38.36 
 
 
537 aa  56.6  8e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3063  flagellar hook-length control protein  38.36 
 
 
718 aa  56.6  8e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.954903  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1442  flagellar hook-length control protein  38.36 
 
 
702 aa  55.8  1e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.822312  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  35.56 
 
 
487 aa  55.5  1e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1329  flagellar hook-length control protein  32.76 
 
 
495 aa  55.5  2e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214505  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  36.36 
 
 
674 aa  53.9  5e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1623  flagellar hook-length control protein  35.62 
 
 
544 aa  53.9  5e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1366  flagellar hook-length control protein  37.08 
 
 
508 aa  53.5  7e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4663  flagellar hook-length control protein  33.64 
 
 
390 aa  52.8  1e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  31.78 
 
 
686 aa  52.4  2e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3916  flagellar hook-length control protein  28.99 
 
 
656 aa  51.6  2e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3832  flagellar hook-length control protein  30.43 
 
 
660 aa  52  2e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  35.94 
 
 
623 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0714  flagellar hook-length control protein  41.94 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1989  flagellar hook-length control protein  34.15 
 
 
394 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2817  flagellar hook-length control protein  40.38 
 
 
408 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0900744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0280  lateral flagellar hook length control protein LafE  28.09 
 
 
353 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00112639  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2905  flagellar hook-length control protein  38.71 
 
 
478 aa  47.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06190  flagellar protein  32.14 
 
 
434 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0480838  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00976  flagellar protein  32.14 
 
 
434 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  39.66 
 
 
593 aa  47.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0179  flagellar hook-length control protein, putative  31.63 
 
 
381 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.501207  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0231  flagellar hook-length control protein, putative  26.49 
 
 
380 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02883  polar flagellar hook-length control protein FliK  34.29 
 
 
768 aa  46.6  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0438685  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3354  flagellar hook-length control protein  28.09 
 
 
353 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.26505  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1544  flagellar hook-length control protein  36.76 
 
 
453 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.213285  normal  0.574566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2534  flagellar hook-length control protein  32.04 
 
 
407 aa  46.2  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.658569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3061  flagellar hook-length control protein  36.47 
 
 
609 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.15551  normal  0.0461289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0416  hypothetical protein  29.17 
 
 
479 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3449  flagellar hook-length control protein  28.95 
 
 
467 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3432  flagellar hook-length control protein  29.2 
 
 
570 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1966  flagellar hook-length control protein FliK  28.95 
 
 
474 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.471768  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1886  flagellar hook-length control protein  33.78 
 
 
430 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1163  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.193048  normal  0.0180974 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  34.57 
 
 
580 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2303  polar flagellar hook-length control protein FliK  26.47 
 
 
407 aa  44.3  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3686  flagellar hook-length control protein  35.29 
 
 
435 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2580  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 
431 aa  43.1  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549964  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0575  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 
552 aa  43.1  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4361  flagellar hook-length control protein  35.29 
 
 
421 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3922  flagellar hook-length control protein  35.29 
 
 
421 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1506  flagellar hook-length control protein  35.29 
 
 
421 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  0.0562001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>