224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3355 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  100 
 
 		 210 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  94.69 
 
 		 209 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  94.69 
 
 		 209 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  95.17 
 
 		 209 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  94.69 
 
 		 209 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  94.69 
 
 		 209 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  93.63 
 
 		 208 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  93.14 
 
 		 208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  93.14 
 
 		 208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  91.18 
 
 		 209 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  86.54 
 
 		 209 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  75.73 
 
 		 212 aa  336  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  74.51 
 
 		 209 aa  322  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  72.14 
 
 		 207 aa  310  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  64.82 
 
 		 205 aa  266  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  61.19 
 
 		 202 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  62.25 
 
 		 209 aa  261  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  60.7 
 
 		 206 aa  258  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  59.62 
 
 		 208 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  60 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  60.4 
 
 		 201 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  59.8 
 
 		 230 aa  255  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  61.19 
 
 		 201 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  61.19 
 
 		 201 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  61.31 
 
 		 205 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  58.17 
 
 		 209 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  59.42 
 
 		 209 aa  251  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  61.19 
 
 		 201 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  59.02 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  58.85 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  57.43 
 
 		 205 aa  248  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  59.33 
 
 		 208 aa  248  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  58.54 
 
 		 207 aa  248  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  59.33 
 
 		 208 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  59.33 
 
 		 221 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  59.8 
 
 		 205 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  59.33 
 
 		 208 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  59.42 
 
 		 218 aa  247  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  60.3 
 
 		 205 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  58.85 
 
 		 208 aa  244  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  58.05 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  57.21 
 
 		 206 aa  237  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  57.84 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  54.23 
 
 		 210 aa  231  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  55.17 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  52.22 
 
 		 208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  54.63 
 
 		 205 aa  214  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  52.48 
 
 		 221 aa  213  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  54.95 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  52.97 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  52.02 
 
 		 184 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  51.65 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  46.41 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  62.96 
 
 		 140 aa  179  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  46.53 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  47.51 
 
 		 203 aa  171  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  45.05 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  43.28 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  44.71 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  42.79 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  44.02 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  43.28 
 
 		 201 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  44.27 
 
 		 201 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.28 
 
 		 201 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  43 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  40.62 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  41.95 
 
 		 203 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  43.65 
 
 		 194 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  43.65 
 
 		 194 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  44.2 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.31 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.86 
 
 		 203 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  43.39 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  40.91 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  41.21 
 
 		 201 aa  151  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  46.54 
 
 		 212 aa  147  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  40.84 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  40.84 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  39.79 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  43.27 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  37.38 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  36.9 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  34.78 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  32.67 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.8 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  38.34 
 
 		 216 aa  111  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.32 
 
 		 199 aa  111  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  34.72 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  34.34 
 
 		 292 aa  110  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  39.75 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.77 
 
 		 294 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.55 
 
 		 216 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  37.7 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.84 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.22 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  33.72 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1494  hypothetical protein  45.45 
 
 		 124 aa  105  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  35.79 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  35.79 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78913  flavoprotein oxygenase  36.79 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>