53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3096 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  455  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.06475e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  98.23 
 
 
226 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.59273e-07  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  98.23 
 
 
226 aa  448  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.09083e-06  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  98.23 
 
 
226 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  7.17729e-07  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  96.9 
 
 
226 aa  443  1e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.29781e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  96.9 
 
 
226 aa  443  1e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  96.9 
 
 
226 aa  443  1e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  96.9 
 
 
226 aa  443  1e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  5.56938e-05  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  95.58 
 
 
226 aa  439  1e-122  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  87.17 
 
 
226 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.26131e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  83.19 
 
 
226 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  7.24256e-05  hitchhiker  2.83379e-08 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  82.3 
 
 
226 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  80.89 
 
 
226 aa  380  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.30211e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  81.33 
 
 
226 aa  381  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  79.65 
 
 
226 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.53337e-08  unclonable  1.17044e-08 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  75.66 
 
 
226 aa  359  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  69.33 
 
 
226 aa  327  9e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  65.33 
 
 
228 aa  318  4e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  65.33 
 
 
228 aa  314  7e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.82127e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  64.29 
 
 
225 aa  305  4e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  64 
 
 
226 aa  298  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  59.56 
 
 
226 aa  289  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  58.67 
 
 
226 aa  284  7e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  65.46 
 
 
195 aa  274  9e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  53.78 
 
 
225 aa  257  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  52.44 
 
 
225 aa  254  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  52 
 
 
225 aa  253  1e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  49.78 
 
 
223 aa  238  4e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  49.78 
 
 
223 aa  238  6e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  49.54 
 
 
224 aa  233  2e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  49.11 
 
 
226 aa  220  1e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  51.57 
 
 
226 aa  219  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  47.32 
 
 
226 aa  219  4e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  47.3 
 
 
226 aa  216  3e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  46.61 
 
 
238 aa  211  6e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  46.08 
 
 
224 aa  201  7e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  44.44 
 
 
227 aa  175  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  29.55 
 
 
227 aa  121  1e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  29.03 
 
 
224 aa  113  3e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  27.6 
 
 
222 aa  101  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  29.15 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  4.05279e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  28.44 
 
 
217 aa  80.1  3e-14  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  26.98 
 
 
217 aa  74.7  1e-12  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  23.7 
 
 
212 aa  71.2  1e-11  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  24.74 
 
 
222 aa  60.1  3e-08  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  1.15743e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0036  Putitive phosphate transport regulator  24.31 
 
 
218 aa  59.7  3e-08  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3780  phosphate transport regulator-like  27.34 
 
 
226 aa  59.7  4e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  24.43 
 
 
222 aa  58.9  6e-08  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.9589e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  24.31 
 
 
223 aa  58.2  1e-07  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  23.3 
 
 
213 aa  52.8  4e-06  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  23.3 
 
 
213 aa  52.8  4e-06  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  21.23 
 
 
224 aa  49.3  5e-05  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  2.13235e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1332  hypothetical protein  24.62 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>