More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3006 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 331 aa  683    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  80.36 
 
 		 326 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  80.36 
 
 		 326 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  79.46 
 
 		 326 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  79.15 
 
 		 326 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  83.33 
 
 		 320 aa  536  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  83.5 
 
 		 320 aa  536  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  83.5 
 
 		 320 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  83.17 
 
 		 320 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  64.8 
 
 		 305 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  66.67 
 
 		 305 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  59.31 
 
 		 307 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  61.84 
 
 		 296 aa  394  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  52.63 
 
 		 295 aa  323  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  52.63 
 
 		 295 aa  323  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  52.63 
 
 		 295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  50.99 
 
 		 295 aa  317  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  50.16 
 
 		 295 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  49.19 
 
 		 297 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  49.5 
 
 		 295 aa  298  8e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  47.88 
 
 		 295 aa  296  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  48.21 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  47.23 
 
 		 298 aa  294  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  50.17 
 
 		 295 aa  291  9e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  48.2 
 
 		 295 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  46.82 
 
 		 296 aa  289  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  52.4 
 
 		 254 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  47.44 
 
 		 295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  45.78 
 
 		 303 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  45.45 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  46.47 
 
 		 295 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  43.91 
 
 		 299 aa  272  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  45.36 
 
 		 294 aa  269  5e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  46.18 
 
 		 295 aa  268  8e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  45.21 
 
 		 296 aa  259  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2322  carboxymethylenebutenolidase  47.37 
 
 		 310 aa  245  9e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  41.64 
 
 		 291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  38.66 
 
 		 291 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  38.36 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  37.42 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  32.04 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02824  hypothetical protein  51.85 
 
 		 136 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3428  carboxymethylenebutenolidase  51.7 
 
 		 145 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02825  hypothetical protein  54.2 
 
 		 116 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  35.38 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  36.06 
 
 		 227 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  31.79 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  33.82 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  33.82 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  36.14 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  33.8 
 
 		 248 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  32.85 
 
 		 230 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  28.47 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  33.18 
 
 		 251 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  30.69 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  29.37 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  31.88 
 
 		 230 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  28.47 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  30.43 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  30.43 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  31.4 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  30.92 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  31.58 
 
 		 264 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  31.88 
 
 		 230 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  34.91 
 
 		 246 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  31.73 
 
 		 232 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  34.83 
 
 		 223 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  32.49 
 
 		 292 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  33.82 
 
 		 227 aa  97.4  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  32.21 
 
 		 230 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  37.13 
 
 		 222 aa  97.1  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  30.95 
 
 		 277 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  32.37 
 
 		 230 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  32.37 
 
 		 230 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  32.37 
 
 		 230 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  32.37 
 
 		 230 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  30.92 
 
 		 232 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  32.37 
 
 		 230 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  32.37 
 
 		 230 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  32.37 
 
 		 230 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  30.23 
 
 		 410 aa  95.9  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  33.83 
 
 		 223 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  30.52 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  31.4 
 
 		 230 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  27.17 
 
 		 409 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  32.3 
 
 		 250 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  31.31 
 
 		 275 aa  93.6  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  33.6 
 
 		 224 aa  92.8  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  27.17 
 
 		 409 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  31.55 
 
 		 234 aa  92.8  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  34.68 
 
 		 224 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  35.45 
 
 		 246 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  30.81 
 
 		 231 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  31.13 
 
 		 242 aa  92  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  27.17 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  31.92 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  31.13 
 
 		 242 aa  92  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  27.17 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>