237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2945 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1019  glycerol dehydrogenase  97.28 
 
 
371 aa  686    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.556711  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3356  glycerol dehydrogenase  96.47 
 
 
371 aa  684    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1007  glycerol dehydrogenase  97.28 
 
 
371 aa  687    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  100 
 
 
372 aa  762    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0985  glycerol dehydrogenase  96.73 
 
 
371 aa  684    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  51.11 
 
 
367 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  51.11 
 
 
367 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  51.11 
 
 
367 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  51.11 
 
 
367 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  51.11 
 
 
367 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  50.69 
 
 
379 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  50 
 
 
367 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  50 
 
 
367 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  50 
 
 
367 aa  360  3e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  50 
 
 
367 aa  360  3e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  50 
 
 
367 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  50 
 
 
367 aa  360  3e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  50 
 
 
367 aa  360  3e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  49.72 
 
 
367 aa  358  6e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  49.72 
 
 
367 aa  358  9e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  49.3 
 
 
367 aa  358  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.51 
 
 
364 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  45.25 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.71 
 
 
368 aa  326  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  46.63 
 
 
360 aa  323  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  46.17 
 
 
364 aa  322  8e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  46.17 
 
 
364 aa  322  8e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.49 
 
 
366 aa  317  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  43.82 
 
 
365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  42.27 
 
 
362 aa  298  1e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  42.86 
 
 
366 aa  298  1e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  42.25 
 
 
383 aa  292  8e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.97 
 
 
380 aa  291  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.7 
 
 
363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  42.94 
 
 
369 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  42.11 
 
 
369 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  41.83 
 
 
369 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  40.56 
 
 
364 aa  275  9e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.95 
 
 
373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  41.55 
 
 
369 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0772  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.32 
 
 
367 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.277229  normal  0.0195639 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.23 
 
 
364 aa  268  8.999999999999999e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.5 
 
 
385 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 
383 aa  267  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  39.78 
 
 
395 aa  262  6e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  38.2 
 
 
367 aa  257  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.78 
 
 
365 aa  256  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.18 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  39.68 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
374 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6106  glycerol dehydrogenase  35.97 
 
 
374 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25848  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  39.94 
 
 
365 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  37.27 
 
 
371 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  34.99 
 
 
367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.1 
 
 
364 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  36.11 
 
 
398 aa  205  9e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4666  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.92 
 
 
360 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0011  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.93 
 
 
381 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556568  normal  0.0107863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
385 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
363 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.49 
 
 
373 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.85 
 
 
373 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.72 
 
 
377 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  30.67 
 
 
366 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1714  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.43 
 
 
362 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.85 
 
 
396 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  31.06 
 
 
359 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0902  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.89 
 
 
373 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 
384 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  27.61 
 
 
364 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
378 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  29.25 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.95 
 
 
367 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.08 
 
 
367 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 
360 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.33 
 
 
358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1626  putative glycerol dehydrogenase  29 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.234673  normal  0.71595 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1052  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 
408 aa  129  7.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0661  glycerol dehydrogenase family protein  27.48 
 
 
372 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11941  putative glycerol dehydrogenase  26.22 
 
 
363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0051  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.85 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00126649  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14931  putative glycerol dehydrogenase  26.46 
 
 
372 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115918  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  29.72 
 
 
362 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.44 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  29.44 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  29.44 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0685  hypothetical protein  29.44 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  31.88 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00567  predicted oxidoreductase  29.38 
 
 
362 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00556  hypothetical protein  29.38 
 
 
362 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730411  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1098  putative glycerol dehydrogenase  28.48 
 
 
363 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0620  hypothetical protein  31.88 
 
 
362 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11931  putative glycerol dehydrogenase  27.24 
 
 
363 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.273319  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0641  hypothetical protein  29.44 
 
 
362 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0760  hypothetical protein  28.97 
 
 
362 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  27.3 
 
 
359 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2414  hypothetical protein  29.78 
 
 
361 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0655  hypothetical protein  29.17 
 
 
362 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0714  hypothetical protein  28.69 
 
 
362 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>