17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2928 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2928  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  642  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3511  hypothetical protein  75.56 
 
 
313 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.529313  hitchhiker  0.00454263 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3290  hypothetical protein  74.3 
 
 
319 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194539  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3386  hypothetical protein  74.14 
 
 
319 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.022865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1068  hypothetical protein  74.14 
 
 
319 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00493933  normal  0.0171581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0981  hypothetical protein  67.48 
 
 
322 aa  439  1e-122  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1154  hypothetical protein  65.29 
 
 
330 aa  434  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1015  hypothetical protein  68.11 
 
 
322 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0977  hypothetical protein  67.49 
 
 
322 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3780  hypothetical protein  58.71 
 
 
303 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0802  hypothetical protein  59.35 
 
 
296 aa  352  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0692  hypothetical protein  57.64 
 
 
306 aa  352  7e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3426  hypothetical protein  57.19 
 
 
320 aa  351  7e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.03182e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1861  hypothetical protein  47.78 
 
 
296 aa  275  6e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1618  hypothetical protein  47.6 
 
 
286 aa  275  9e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3261  hypothetical protein  46.23 
 
 
282 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0918526  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0739  hypothetical protein  46.77 
 
 
291 aa  248  8e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>