76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2783 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  634    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  95.11 
 
 		 307 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  95.44 
 
 		 307 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  95.11 
 
 		 307 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  95.44 
 
 		 307 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  76.35 
 
 		 299 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  76.21 
 
 		 299 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  74.66 
 
 		 299 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  76.21 
 
 		 299 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  51.2 
 
 		 293 aa  318  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  52.59 
 
 		 293 aa  311  6.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  52.74 
 
 		 293 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  56.32 
 
 		 291 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  51.85 
 
 		 291 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  54.74 
 
 		 293 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  49.64 
 
 		 486 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  49.64 
 
 		 395 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  49.64 
 
 		 395 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  48.31 
 
 		 295 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  49.26 
 
 		 295 aa  289  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  48.31 
 
 		 295 aa  289  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  49.64 
 
 		 404 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  48.6 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  49.64 
 
 		 404 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  54.41 
 
 		 296 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  49.64 
 
 		 404 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  47.94 
 
 		 295 aa  288  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  48.9 
 
 		 295 aa  288  9e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  49.64 
 
 		 444 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  51.29 
 
 		 299 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  46.69 
 
 		 287 aa  279  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  45.39 
 
 		 303 aa  269  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  46.81 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  42.55 
 
 		 291 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  45.04 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  47.2 
 
 		 283 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  43.98 
 
 		 317 aa  258  7e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  43.57 
 
 		 291 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  43.61 
 
 		 317 aa  256  4e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  42.96 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  39.8 
 
 		 298 aa  225  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  41.13 
 
 		 304 aa  222  8e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  38.95 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  37.1 
 
 		 288 aa  205  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  36.13 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  38.49 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.75 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  33.6 
 
 		 266 aa  162  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  31.23 
 
 		 293 aa  155  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  30.86 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  34.69 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  27.59 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  26.49 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  26.95 
 
 		 526 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  24.91 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  24.23 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  21.93 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 274 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  23.98 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  24.58 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  22.87 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  23.39 
 
 		 312 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  24.49 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  23.77 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  25.65 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  23.9 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  23.77 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  23.74 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3833  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 		 344 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  22 
 
 		 321 aa  42.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 		 246 aa  42.4  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>