19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2705 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2705  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  236  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00514172  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1319  hypothetical protein  92.98 
 
 
114 aa  224  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.181479  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3201  hypothetical protein  92.11 
 
 
114 aa  222  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.50752  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3058  hypothetical protein  92.11 
 
 
114 aa  222  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0202698  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3044  hypothetical protein  92.11 
 
 
114 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.511414  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3374  hypothetical protein  85.09 
 
 
114 aa  209  9e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1176  hypothetical protein  82.46 
 
 
114 aa  207  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0641915  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1175  hypothetical protein  81.58 
 
 
114 aa  206  8e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.66401e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1246  hypothetical protein  82.46 
 
 
114 aa  206  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.022194  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1109  hypothetical protein  77.19 
 
 
114 aa  196  8e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.249921  normal  0.981627 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1039  hypothetical protein  74.56 
 
 
114 aa  191  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0141429  normal  0.686037 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0961  hypothetical protein  71.05 
 
 
114 aa  187  3e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199387  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2654  hypothetical protein  68.42 
 
 
114 aa  184  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  4.35308e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0931  hypothetical protein  71.93 
 
 
114 aa  171  3e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3035  hypothetical protein  63.16 
 
 
114 aa  165  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3027  hypothetical protein  64.04 
 
 
114 aa  163  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00221718  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1088  hypothetical protein  25 
 
 
110 aa  48.1  4e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003446  hypothetical protein  24.74 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00494887  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02329  hypothetical protein  26.04 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>