115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2670 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3021  extracellular solute-binding protein  77.45 
 
 
487 aa  785  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1212  extracellular solute-binding protein  80.13 
 
 
497 aa  799  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1357  extracellular solute-binding protein family 1  80.91 
 
 
467 aa  786  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  9.53949e-11 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2670  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
482 aa  1000  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00030492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3164  extracellular solute-binding protein  80.04 
 
 
467 aa  781  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.625995  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1213  extracellular solute-binding protein  78.01 
 
 
497 aa  791  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1283  extracellular solute-binding protein  78.63 
 
 
497 aa  796  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3006  extracellular solute-binding protein  80.69 
 
 
467 aa  787  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3333  transporter, putative  79.48 
 
 
481 aa  772  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1533  extracellular solute-binding protein  62.13 
 
 
478 aa  624  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.219593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1420  extracellular solute-binding protein  61.64 
 
 
478 aa  609  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30312  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2375  transporter, putative  61.05 
 
 
479 aa  590  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.229304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 
451 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 
424 aa  94.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 
408 aa  94  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 
428 aa  85.1  3e-15  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 
447 aa  79  2e-13  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 
449 aa  75.5  2e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 
441 aa  75.9  2e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3584  hypothetical protein  25.45 
 
 
484 aa  74.7  3e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.638591  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 
433 aa  74.3  4e-12  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
443 aa  74.3  5e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
443 aa  73.6  7e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
443 aa  73.6  7e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 
444 aa  70.5  7e-11  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3495  extracellular solute-binding protein, family 1  23.46 
 
 
487 aa  69.7  1e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413396  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0258  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 
477 aa  69.3  2e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 
419 aa  68.2  3e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 
436 aa  68.2  3e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 
435 aa  67.8  4e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0287  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 
477 aa  67  7e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  20.83 
 
 
432 aa  66.2  1e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 
419 aa  66.2  1e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 
435 aa  65.5  2e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.13 
 
 
431 aa  65.1  3e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  21.03 
 
 
428 aa  64.7  4e-09  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2051  extracellular solute-binding protein family 1  22.02 
 
 
536 aa  64.3  5e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  20.22 
 
 
422 aa  62  2e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
439 aa  62  2e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 
498 aa  61.6  3e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 
410 aa  61.6  3e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 
444 aa  61.6  3e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.62 
 
 
439 aa  61.6  3e-08  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 
438 aa  61.2  4e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.62 
 
 
439 aa  60.1  9e-08  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 
386 aa  58.5  2e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  21.17 
 
 
441 aa  58.2  3e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 
477 aa  57.8  4e-07  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 
439 aa  57.8  5e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 
440 aa  57.8  5e-07  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.53 
 
 
486 aa  56.6  9e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  22.05 
 
 
436 aa  54.3  5e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 
395 aa  53.9  7e-06  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  7.29506e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 
436 aa  53.1  1e-05  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  23.78 
 
 
447 aa  53.1  1e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  21.79 
 
 
440 aa  53.1  1e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 
435 aa  52  2e-05  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 
446 aa  52.8  2e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  21.87 
 
 
391 aa  51.6  3e-05  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 
443 aa  52  3e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 
448 aa  51.6  3e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  21.87 
 
 
391 aa  51.6  3e-05  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  3.98035e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 
428 aa  51.2  4e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  24.42 
 
 
439 aa  51.2  4e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 
431 aa  51.2  4e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  21.18 
 
 
484 aa  50.4  7e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.7 
 
 
496 aa  50.1  9e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 
436 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 
412 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.33 
 
 
326 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  21.7 
 
 
440 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 
419 aa  49.3  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 
439 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2064  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 
439 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1201  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 
572 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.487559  normal  0.842714 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 
419 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  20.39 
 
 
443 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2902  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 
439 aa  47.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 
435 aa  48.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0572  extracellular solute-binding protein family 1  22.46 
 
 
470 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0271  extracellular solute-binding protein family 1  21.91 
 
 
387 aa  47.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  24.9 
 
 
423 aa  47.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  3.07561e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 
436 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 
412 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 
441 aa  47  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  31.07 
 
 
423 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  21.94 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  2.41977e-07  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  22.4 
 
 
442 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  21.97 
 
 
484 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5926  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.27 
 
 
441 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517551  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 
425 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 
442 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  22.4 
 
 
442 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  22.4 
 
 
442 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3317  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
492 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.42443e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  22.4 
 
 
442 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  22.4 
 
 
442 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  22.4 
 
 
442 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0695  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  23.55 
 
 
441 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>