More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2644 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
164 aa  340  5e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  90.8 
 
 
175 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  89.63 
 
 
174 aa  310  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  90.8 
 
 
175 aa  309  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  90.18 
 
 
175 aa  309  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  84.57 
 
 
222 aa  293  7e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  84.57 
 
 
252 aa  275  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3291  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  85.8 
 
 
194 aa  273  9e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1307  tRNA-adenosine deaminase  83.95 
 
 
222 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  75.16 
 
 
177 aa  250  7e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  74.5 
 
 
189 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  67.92 
 
 
178 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  66.24 
 
 
169 aa  230  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  67.32 
 
 
177 aa  224  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  65.61 
 
 
170 aa  223  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  63.35 
 
 
200 aa  223  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  63.35 
 
 
200 aa  221  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  62.73 
 
 
187 aa  220  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  61.78 
 
 
165 aa  219  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.56 
 
 
164 aa  219  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  66.46 
 
 
190 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1315  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  69.57 
 
 
163 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.847285  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  60.65 
 
 
168 aa  210  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  62.09 
 
 
176 aa  209  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  61.29 
 
 
167 aa  208  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  60 
 
 
169 aa  207  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  60.76 
 
 
172 aa  207  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  60.76 
 
 
172 aa  207  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  60.76 
 
 
172 aa  207  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  60.65 
 
 
178 aa  207  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  60.65 
 
 
167 aa  207  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  60.65 
 
 
178 aa  207  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  60.65 
 
 
178 aa  207  7e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  60.65 
 
 
167 aa  207  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  60.65 
 
 
178 aa  207  7e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  60.69 
 
 
223 aa  206  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  60.13 
 
 
172 aa  206  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60 
 
 
168 aa  206  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  60.13 
 
 
172 aa  206  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  60 
 
 
178 aa  204  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  60 
 
 
167 aa  204  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  63.29 
 
 
182 aa  200  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  64.94 
 
 
164 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  59.33 
 
 
166 aa  193  9e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  60.51 
 
 
193 aa  192  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  60 
 
 
158 aa  191  5e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.21 
 
 
162 aa  190  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.71 
 
 
231 aa  187  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60.14 
 
 
484 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.14 
 
 
152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  58.22 
 
 
155 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  54.9 
 
 
163 aa  180  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.92 
 
 
160 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.24 
 
 
361 aa  180  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  62.24 
 
 
361 aa  180  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  55.56 
 
 
168 aa  179  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  57.33 
 
 
165 aa  177  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.55 
 
 
182 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.55 
 
 
182 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.1 
 
 
152 aa  176  9e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.29 
 
 
475 aa  176  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.99 
 
 
174 aa  176  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777873  normal  0.277053 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  54.11 
 
 
148 aa  174  7e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  54.11 
 
 
148 aa  174  7e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  54.14 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  54.25 
 
 
166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0024  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  50.93 
 
 
166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000145543  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.79 
 
 
154 aa  171  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0019  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  50.93 
 
 
166 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0510921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  51.57 
 
 
166 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  54.55 
 
 
182 aa  169  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0020  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  51.25 
 
 
166 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.25 
 
 
166 aa  170  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.25 
 
 
166 aa  169  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.736614  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1037  tRNA-specific adenosine deaminase  59.73 
 
 
162 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  51.25 
 
 
166 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  51.25 
 
 
166 aa  170  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  55.17 
 
 
175 aa  168  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.42 
 
 
154 aa  168  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  57.35 
 
 
137 aa  167  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  50.65 
 
 
183 aa  167  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.33 
 
 
461 aa  167  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  57.53 
 
 
151 aa  167  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00919  tRNA-specific adenosine deaminase  52.35 
 
 
170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0773913  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  54.79 
 
 
146 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  54.29 
 
 
177 aa  164  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.29 
 
 
166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56 
 
 
363 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  52.05 
 
 
152 aa  164  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1685  hypothetical protein  52.7 
 
 
149 aa  164  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1686  hypothetical protein  52.7 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.26 
 
 
164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.34 
 
 
164 aa  161  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  56.92 
 
 
151 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2796  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.67 
 
 
369 aa  160  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1712  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.45 
 
 
167 aa  160  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.344098  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.9 
 
 
411 aa  160  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.23 
 
 
166 aa  160  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1748  tRNA-adenosine deaminase  56.16 
 
 
205 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00208224  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.62 
 
 
181 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>