More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2634 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
209 aa  430  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  82.21 
 
 
206 aa  351  5e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  82.21 
 
 
206 aa  349  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  81.73 
 
 
206 aa  349  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  85.1 
 
 
208 aa  347  7e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  84.62 
 
 
216 aa  347  9e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  84.13 
 
 
216 aa  343  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  84.13 
 
 
216 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  86.17 
 
 
188 aa  339  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  66.67 
 
 
226 aa  279  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  64.65 
 
 
207 aa  272  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  63.37 
 
 
203 aa  266  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  62.12 
 
 
205 aa  262  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  61.5 
 
 
210 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  64.22 
 
 
206 aa  248  7e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  58.67 
 
 
206 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  38.5 
 
 
224 aa  121  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  35.05 
 
 
217 aa  105  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 
226 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.7 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
211 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
209 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
228 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  30.05 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
216 aa  92.8  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 
214 aa  92.8  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 
207 aa  92.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 
207 aa  92  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
213 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
213 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 
215 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 
220 aa  88.2  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
234 aa  88.2  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
257 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 
220 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  28.87 
 
 
207 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 
226 aa  85.1  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  30.06 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  35.71 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  34.56 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
210 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
208 aa  82  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 
236 aa  81.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  29.69 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 
220 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  34.56 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  34.56 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  33.57 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  33.09 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  30.46 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  30.37 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  26.05 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  30.88 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
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NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal 
 
 
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NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  29.27 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
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NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
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NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
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NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
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NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
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