81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2630 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  100 
 
 
821 aa  1685    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  65.37 
 
 
823 aa  1109    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  59.32 
 
 
822 aa  987    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  41.77 
 
 
826 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  58.31 
 
 
822 aa  975    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  44.57 
 
 
833 aa  677    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  46.08 
 
 
841 aa  720    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  59.52 
 
 
820 aa  1000    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  39.64 
 
 
824 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  38.25 
 
 
825 aa  558  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  38.43 
 
 
826 aa  544  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  29.75 
 
 
841 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
839 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 
826 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 
826 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  29.46 
 
 
837 aa  346  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  26.91 
 
 
833 aa  296  9e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  28.3 
 
 
812 aa  281  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  29.98 
 
 
871 aa  227  8e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  27.69 
 
 
429 aa  87.4  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  28.14 
 
 
618 aa  86.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  27.68 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  29.17 
 
 
629 aa  74.3  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  27.73 
 
 
608 aa  73.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  27.19 
 
 
446 aa  73.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  26.51 
 
 
470 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  25.86 
 
 
431 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  28.24 
 
 
700 aa  68.6  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  25.19 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  29.38 
 
 
629 aa  68.2  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  23.55 
 
 
666 aa  67.8  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  25.95 
 
 
430 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  26.27 
 
 
604 aa  65.1  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  23.88 
 
 
632 aa  65.1  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  24.89 
 
 
435 aa  64.7  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  24.89 
 
 
435 aa  64.7  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  25.88 
 
 
433 aa  62.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  22.56 
 
 
570 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  26.43 
 
 
578 aa  63.5  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  26.38 
 
 
673 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  27.81 
 
 
635 aa  62.8  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  24.57 
 
 
671 aa  62.4  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  24.9 
 
 
638 aa  62  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  20.79 
 
 
891 aa  61.2  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  25.3 
 
 
442 aa  61.2  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  25.3 
 
 
442 aa  60.8  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  25.2 
 
 
626 aa  60.5  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  26.25 
 
 
607 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  23.75 
 
 
653 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  27.57 
 
 
662 aa  57.8  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  21.15 
 
 
589 aa  57.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  24.56 
 
 
605 aa  57.8  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  22.71 
 
 
758 aa  57.8  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  24.23 
 
 
431 aa  57.8  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  20.89 
 
 
616 aa  57.4  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  22.03 
 
 
605 aa  57.4  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  25.77 
 
 
676 aa  57  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  24.31 
 
 
638 aa  56.2  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  25.43 
 
 
507 aa  55.8  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  23.29 
 
 
577 aa  55.5  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  25 
 
 
627 aa  55.5  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  22.5 
 
 
626 aa  55.5  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  21.85 
 
 
649 aa  55.1  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  22.99 
 
 
1179 aa  55.1  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  22.46 
 
 
661 aa  53.5  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  23.47 
 
 
623 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  21.17 
 
 
578 aa  53.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  21.93 
 
 
605 aa  52.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  26.04 
 
 
648 aa  50.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  20.94 
 
 
647 aa  50.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  22.77 
 
 
645 aa  49.3  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2415  hypothetical protein  21.39 
 
 
656 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.174354  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1044  protein of unknown function DUF115  24 
 
 
560 aa  49.3  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  24.1 
 
 
625 aa  48.9  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 
615 aa  48.5  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.21 
 
 
616 aa  48.5  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.89 
 
 
297 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.89 
 
 
297 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  24.86 
 
 
617 aa  45.4  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  23.33 
 
 
702 aa  44.7  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 
313 aa  44.3  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>