More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2594 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  91.61 
 
 		 453 aa  815    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  90.51 
 
 		 453 aa  811    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  79.47 
 
 		 453 aa  741    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 453 aa  909    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  76.21 
 
 		 454 aa  702    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1600  flagellar hook protein FlgE  80.13 
 
 		 453 aa  720    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.998442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  90.51 
 
 		 453 aa  811    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  78.9 
 
 		 455 aa  713    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  91.61 
 
 		 453 aa  797    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1332  flagellar hook protein FlgE  91.83 
 
 		 453 aa  800    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  79.25 
 
 		 453 aa  705    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  80.39 
 
 		 459 aa  710    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  85.65 
 
 		 460 aa  787    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  90.51 
 
 		 453 aa  811    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  91.61 
 
 		 453 aa  816    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  80.35 
 
 		 453 aa  748    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  53.62 
 
 		 461 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  52.97 
 
 		 458 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  47.36 
 
 		 425 aa  385  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2335  flagellar hook protein FlgE  50 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1789  flagellar hook protein FlgE  47.49 
 
 		 434 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004170  flagellar hook protein FlgE  46.25 
 
 		 437 aa  364  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01289  flagellar hook protein FlgE  45.97 
 
 		 437 aa  355  8.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  44.28 
 
 		 418 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  38.92 
 
 		 435 aa  293  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1716  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.35 
 
 		 423 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.727886  normal  0.851107 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0080  flagellar hook protein FlgE  39.35 
 
 		 423 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  38.25 
 
 		 438 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  39.56 
 
 		 407 aa  279  9e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  39.56 
 
 		 407 aa  279  9e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1480  flagellar hook protein FlgE  57.5 
 
 		 554 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  38.56 
 
 		 462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  37.14 
 
 		 408 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  38.29 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  39.57 
 
 		 462 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  38.46 
 
 		 405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  36.7 
 
 		 420 aa  266  5e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.96 
 
 		 418 aa  262  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  38.6 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  38.88 
 
 		 442 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  38.72 
 
 		 451 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  38.41 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  38.04 
 
 		 440 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  39.3 
 
 		 440 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1669  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.47 
 
 		 423 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456133  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  38.48 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  35.46 
 
 		 410 aa  251  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  37.25 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  37.94 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  35.54 
 
 		 401 aa  250  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  35.24 
 
 		 402 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  35.02 
 
 		 442 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  35.24 
 
 		 402 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  37.12 
 
 		 414 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.06 
 
 		 430 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.69 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  36.76 
 
 		 413 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  36.76 
 
 		 413 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  36.29 
 
 		 437 aa  245  9e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  36.38 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  36.54 
 
 		 413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  37.89 
 
 		 413 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  33.92 
 
 		 401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.07 
 
 		 423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  37.44 
 
 		 413 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  37.44 
 
 		 413 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  37.44 
 
 		 413 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  37.44 
 
 		 413 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  37.44 
 
 		 413 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  37.44 
 
 		 413 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  36.26 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  36.04 
 
 		 413 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  35.46 
 
 		 402 aa  239  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  35.15 
 
 		 398 aa  239  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.72 
 
 		 426 aa  237  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  34.88 
 
 		 399 aa  236  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  36.7 
 
 		 413 aa  236  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  35.28 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  36.64 
 
 		 402 aa  233  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  35.36 
 
 		 425 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  34.65 
 
 		 414 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  34.65 
 
 		 414 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  34.65 
 
 		 414 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  34.65 
 
 		 414 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  37.34 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  35.82 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  35.82 
 
 		 398 aa  229  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  35.76 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  34.36 
 
 		 398 aa  227  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  35.82 
 
 		 387 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  34.29 
 
 		 410 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3465  flagellar hook protein FlgE  35.54 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.51 
 
 		 400 aa  219  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  34.29 
 
 		 400 aa  217  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  34.36 
 
 		 402 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  33.19 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  35.53 
 
 		 404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  34.49 
 
 		 401 aa  207  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  34.13 
 
 		 401 aa  206  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2951  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.01 
 
 		 501 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.431038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>