162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2574 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  100 
 
 		 318 aa  642    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  66.96 
 
 		 338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  67.25 
 
 		 338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  66.96 
 
 		 338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  66.96 
 
 		 338 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  72.67 
 
 		 316 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  71.84 
 
 		 316 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  72.73 
 
 		 320 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  71.84 
 
 		 316 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  55.43 
 
 		 334 aa  323  3e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  56.39 
 
 		 324 aa  294  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  52.99 
 
 		 403 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  47.21 
 
 		 316 aa  276  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  54.96 
 
 		 339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  49.62 
 
 		 300 aa  255  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  52.07 
 
 		 375 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  38.11 
 
 		 266 aa  152  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  31.75 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  32.41 
 
 		 262 aa  139  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  35.48 
 
 		 260 aa  139  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  30.36 
 
 		 266 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  31.17 
 
 		 266 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  31.87 
 
 		 265 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  31.62 
 
 		 295 aa  126  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  35.53 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  30.68 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  36.84 
 
 		 243 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  32.52 
 
 		 228 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  32.52 
 
 		 236 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  30 
 
 		 251 aa  90.9  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  29.17 
 
 		 255 aa  89  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  31.9 
 
 		 228 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  30.16 
 
 		 278 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  31.9 
 
 		 228 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  31.12 
 
 		 245 aa  86.3  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  31.98 
 
 		 226 aa  86.3  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  29.22 
 
 		 240 aa  86.3  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  31.29 
 
 		 228 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  31.29 
 
 		 228 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  30.29 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  31.29 
 
 		 228 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  28.18 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  26.97 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1271  flagellar assembly protein H  31.87 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1148  flagellar assembly protein H  31.87 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  31.87 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2129  flagellar assembly protein H  31.87 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  31.87 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  30.93 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  26.91 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  35.26 
 
 		 201 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  28.57 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  29.49 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  31.16 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  31.47 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  27.72 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  27.72 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0435  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  29.11 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00322204  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  26 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  33.86 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  28.91 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  27.72 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  31.63 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  29.21 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  28.78 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  29.21 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  29.21 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  28.74 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  29.81 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  30.73 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  28.74 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  28.74 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  27.43 
 
 		 225 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  29.19 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  26.77 
 
 		 252 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  27.5 
 
 		 234 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  29.35 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  29.26 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  28.96 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  28 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  28.73 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1878  flagellar assembly protein FliH  27.74 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479163  normal  0.528624 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  28.99 
 
 		 231 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  29.38 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  28.12 
 
 		 227 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  29.34 
 
 		 227 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  29.38 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  28.75 
 
 		 225 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  23.2 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  26.13 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  29.38 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  28.74 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  27.49 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  23.33 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  29.19 
 
 		 201 aa  67  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  26.95 
 
 		 207 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  24.1 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  27.54 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  27.54 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>