More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2545 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  82.44 
 
 
489 aa  845  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  6.07679e-08  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  79.52 
 
 
491 aa  800  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  86.63 
 
 
501 aa  905  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.64206e-06  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  96.31 
 
 
324 aa  639  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  86.63 
 
 
501 aa  904  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  82.24 
 
 
489 aa  843  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  3.02128e-07  hitchhiker  7.91426e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  80.92 
 
 
490 aa  805  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.91592e-07  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  82.44 
 
 
489 aa  845  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  81.27 
 
 
490 aa  806  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  5.1541e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  85.23 
 
 
501 aa  882  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  81.44 
 
 
500 aa  839  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.47826e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  82.04 
 
 
489 aa  788  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  86.03 
 
 
501 aa  900  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  5.44318e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  81.84 
 
 
489 aa  822  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  3.17071e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  100 
 
 
501 aa  1013  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  62.13 
 
 
451 aa  579  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  61.52 
 
 
462 aa  575  1e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  61.89 
 
 
462 aa  570  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  52.12 
 
 
479 aa  511  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  43.68 
 
 
461 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  45.55 
 
 
446 aa  368  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  45.55 
 
 
446 aa  368  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  46.34 
 
 
461 aa  362  6e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  46.1 
 
 
461 aa  360  4e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  9.84184e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  43.7 
 
 
463 aa  360  5e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  42.92 
 
 
461 aa  353  5e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  8.22499e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  42.92 
 
 
461 aa  353  5e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.79304e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  42.92 
 
 
461 aa  353  5e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  3.9773e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  42.92 
 
 
461 aa  353  5e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.79263e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  42.71 
 
 
461 aa  352  8e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  3.69558e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  45.16 
 
 
463 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  42.71 
 
 
461 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87987e-11 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  42.83 
 
 
461 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  7.40471e-06  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  43.12 
 
 
461 aa  351  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.92962e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  42.5 
 
 
461 aa  350  4e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.67379e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  46.27 
 
 
452 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.52854e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  46.27 
 
 
452 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  42.74 
 
 
461 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.79332e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  44.07 
 
 
444 aa  345  1e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  43.25 
 
 
449 aa  343  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.38038e-07  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  42.83 
 
 
449 aa  343  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  43.38 
 
 
449 aa  343  5e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.99815e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  43.38 
 
 
449 aa  343  5e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.21919e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  44.93 
 
 
463 aa  340  3e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  46.4 
 
 
464 aa  338  2e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  44.3 
 
 
467 aa  332  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  46.67 
 
 
395 aa  329  6e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.14111e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  43.29 
 
 
432 aa  328  1e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  44.22 
 
 
504 aa  323  6e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0920  amino acid/peptide transporter  42.7 
 
 
436 aa  316  7e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  3.08736e-09  unclonable  5.10372e-19 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  38.13 
 
 
501 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3195  peptide transporter  88.57 
 
 
176 aa  298  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  37.43 
 
 
499 aa  296  9e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  36.54 
 
 
510 aa  295  1e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  36.47 
 
 
510 aa  295  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  37.85 
 
 
527 aa  290  4e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  36.36 
 
 
497 aa  279  9e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  35.4 
 
 
497 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  37.4 
 
 
516 aa  274  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  33.65 
 
 
495 aa  273  5e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  36.32 
 
 
499 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  4.22142e-07 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  35.63 
 
 
477 aa  271  2e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  3.22625e-05  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  37.61 
 
 
498 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  39.12 
 
 
471 aa  267  3e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  35.71 
 
 
495 aa  266  8e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  35.26 
 
 
516 aa  261  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  37.5 
 
 
544 aa  260  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  36.42 
 
 
524 aa  258  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  34.29 
 
 
507 aa  256  6e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  34.11 
 
 
501 aa  255  1e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  34.11 
 
 
501 aa  255  1e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  35.04 
 
 
502 aa  255  1e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  34.21 
 
 
520 aa  255  2e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  34.78 
 
 
496 aa  253  4e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  34.53 
 
 
509 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  35.75 
 
 
490 aa  249  6e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  33.27 
 
 
498 aa  248  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.67951e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  33.07 
 
 
483 aa  246  5e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  33.68 
 
 
501 aa  246  6e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  34.35 
 
 
499 aa  244  2e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  2.59644e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0196  amino acid/peptide transporter  33.89 
 
 
566 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  34.55 
 
 
544 aa  244  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  33.72 
 
 
512 aa  243  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  33.72 
 
 
512 aa  243  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  36.72 
 
 
558 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  33.85 
 
 
517 aa  235  2e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  42.01 
 
 
533 aa  233  6e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  33.93 
 
 
516 aa  231  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  30.83 
 
 
484 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  34.05 
 
 
492 aa  224  3e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  34.05 
 
 
492 aa  224  4e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  34.27 
 
 
497 aa  223  7e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  31.2 
 
 
483 aa  221  2e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  32.75 
 
 
497 aa  219  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  33.77 
 
 
489 aa  219  9e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  33.33 
 
 
494 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0759  major facilitator superfamily peptide/H(+)symporter  30.52 
 
 
513 aa  214  2e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4613  amino acid/peptide transporter  33.56 
 
 
445 aa  214  4e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196943  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  31.58 
 
 
486 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  29.43 
 
 
501 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>