More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2543 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  39.37 
 
 		 897 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  43.55 
 
 		 920 aa  756    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  83.28 
 
 		 921 aa  1603    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  84 
 
 		 912 aa  1596    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  71.54 
 
 		 931 aa  1378    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  72.83 
 
 		 915 aa  1385    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  73.02 
 
 		 920 aa  1392    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  63.16 
 
 		 827 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  68.3 
 
 		 922 aa  1302    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  64.84 
 
 		 828 aa  649    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  65.44 
 
 		 919 aa  1234    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  47.35 
 
 		 828 aa  636    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  68.04 
 
 		 910 aa  1289    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  46.96 
 
 		 828 aa  658    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  100 
 
 		 919 aa  1856    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  52.28 
 
 		 837 aa  628  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  52.28 
 
 		 837 aa  628  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  51.82 
 
 		 837 aa  624  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  36.26 
 
 		 869 aa  599  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  37.33 
 
 		 869 aa  584  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  35.87 
 
 		 852 aa  575  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  35.89 
 
 		 833 aa  355  2.9999999999999997e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 1055 aa  265  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  31.85 
 
 		 948 aa  263  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  31.28 
 
 		 869 aa  253  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  31.91 
 
 		 781 aa  251  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  31.39 
 
 		 834 aa  249  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  30.8 
 
 		 833 aa  249  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  38.06 
 
 		 753 aa  243  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  32.13 
 
 		 952 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  34.89 
 
 		 779 aa  227  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  30.66 
 
 		 977 aa  226  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  31.75 
 
 		 936 aa  224  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  28.53 
 
 		 947 aa  223  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  28.68 
 
 		 812 aa  222  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  31.08 
 
 		 940 aa  214  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  27.52 
 
 		 800 aa  213  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  32.92 
 
 		 830 aa  207  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  36.31 
 
 		 849 aa  206  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  27.3 
 
 		 846 aa  203  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  27.19 
 
 		 824 aa  202  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  29.68 
 
 		 877 aa  195  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.5 
 
 		 877 aa  195  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.5 
 
 		 800 aa  194  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  29.31 
 
 		 875 aa  194  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  29.6 
 
 		 823 aa  193  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  34.21 
 
 		 576 aa  191  4e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  27.05 
 
 		 791 aa  191  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  28.89 
 
 		 803 aa  189  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  28.16 
 
 		 830 aa  179  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  36.31 
 
 		 568 aa  168  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  28.33 
 
 		 580 aa  125  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  36.88 
 
 		 425 aa  115  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  29.01 
 
 		 478 aa  114  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  27.1 
 
 		 473 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  30.45 
 
 		 605 aa  105  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  32.14 
 
 		 552 aa  100  9e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  31.7 
 
 		 552 aa  99.8  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  32 
 
 		 552 aa  99  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  30.94 
 
 		 552 aa  99  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  27.21 
 
 		 579 aa  98.6  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 537 aa  97.8  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  26.73 
 
 		 603 aa  96.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 516 aa  95.5  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  26.09 
 
 		 495 aa  95.1  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  26.01 
 
 		 609 aa  94.7  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  25.78 
 
 		 495 aa  94.7  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  30.34 
 
 		 587 aa  93.6  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  27.66 
 
 		 388 aa  91.7  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  33.67 
 
 		 558 aa  91.3  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  30 
 
 		 508 aa  91.3  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  30 
 
 		 606 aa  90.5  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  24.86 
 
 		 551 aa  90.9  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  27.13 
 
 		 387 aa  90.5  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  26.38 
 
 		 700 aa  90.1  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  25.84 
 
 		 700 aa  88.6  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  23.2 
 
 		 495 aa  87.8  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.83 
 
 		 703 aa  87  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  28.06 
 
 		 362 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  28.14 
 
 		 347 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  28.44 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  28.71 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  25.49 
 
 		 606 aa  85.9  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  29.52 
 
 		 431 aa  83.2  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  29.95 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  29.52 
 
 		 558 aa  81.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  29.52 
 
 		 558 aa  81.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  29.55 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  27.75 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.26 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  29.52 
 
 		 558 aa  81.3  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.26 
 
 		 391 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.26 
 
 		 391 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  26.21 
 
 		 317 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  25.73 
 
 		 373 aa  80.1  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  28.38 
 
 		 397 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  29.53 
 
 		 557 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.67 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.82 
 
 		 396 aa  79.7  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.05 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>