256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2509 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  91.38 
 
 
522 aa  972  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  79.3 
 
 
520 aa  793  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  89.85 
 
 
522 aa  905  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  89.85 
 
 
522 aa  904  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  82.79 
 
 
526 aa  864  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  75.72 
 
 
524 aa  803  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  91.76 
 
 
522 aa  971  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  81.66 
 
 
521 aa  868  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  89.85 
 
 
522 aa  902  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  77.54 
 
 
518 aa  813  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 
522 aa  1036  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  3.17114e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  80.43 
 
 
524 aa  840  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  91.38 
 
 
522 aa  967  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  89.85 
 
 
522 aa  905  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  80.43 
 
 
521 aa  840  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  55.64 
 
 
533 aa  576  1e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  56.03 
 
 
528 aa  578  1e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  55.64 
 
 
533 aa  571  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  55.04 
 
 
533 aa  546  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  54.71 
 
 
526 aa  541  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  54.92 
 
 
529 aa  542  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  54.17 
 
 
521 aa  527  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  51.37 
 
 
527 aa  525  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  47.9 
 
 
515 aa  464  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  45.79 
 
 
520 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  45.6 
 
 
525 aa  362  6e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  45.6 
 
 
525 aa  358  1e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  45 
 
 
533 aa  355  1e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  42.38 
 
 
546 aa  353  4e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  41.51 
 
 
574 aa  346  6e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.04071e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  40.4 
 
 
528 aa  335  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  41.83 
 
 
534 aa  316  8e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  38.36 
 
 
532 aa  306  6e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  37.7 
 
 
550 aa  304  2e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  38.61 
 
 
525 aa  298  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  37.02 
 
 
567 aa  298  2e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  9.2827e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  36.97 
 
 
515 aa  296  6e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  36.53 
 
 
510 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  38.1 
 
 
497 aa  283  4e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  38.26 
 
 
497 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  38.58 
 
 
497 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  37.61 
 
 
507 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  38.17 
 
 
497 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  35.51 
 
 
552 aa  280  6e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  35.38 
 
 
557 aa  279  9e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  36.04 
 
 
497 aa  278  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  36.53 
 
 
501 aa  270  6e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  35.1 
 
 
493 aa  269  8e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  37.17 
 
 
501 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  36.71 
 
 
569 aa  268  3e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  36.01 
 
 
509 aa  267  3e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  35.8 
 
 
567 aa  265  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  34.52 
 
 
571 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  34.32 
 
 
571 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  36.74 
 
 
501 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  34.57 
 
 
570 aa  263  5e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  36.36 
 
 
521 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.86366e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  35.15 
 
 
517 aa  260  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  33.81 
 
 
504 aa  258  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142.2  Na(+)/H(+) antiporter  88.41 
 
 
138 aa  256  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  35.25 
 
 
451 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  33.13 
 
 
513 aa  249  8e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  4.52516e-05  hitchhiker  5.27384e-21 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  37.23 
 
 
561 aa  246  6e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  33.96 
 
 
577 aa  246  6e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  33.83 
 
 
577 aa  244  2e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  36.42 
 
 
508 aa  244  2e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  33.52 
 
 
577 aa  241  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  35.64 
 
 
556 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  33.46 
 
 
587 aa  241  3e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  32.36 
 
 
507 aa  236  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  36.7 
 
 
541 aa  234  4e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  35.46 
 
 
629 aa  231  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  33.13 
 
 
459 aa  229  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  32.49 
 
 
564 aa  227  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  32.44 
 
 
457 aa  227  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  33.73 
 
 
476 aa  224  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  32.41 
 
 
460 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  6.22786e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  32.41 
 
 
460 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  4.66881e-08  decreased coverage  6.62614e-11 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  32.41 
 
 
460 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.61486e-07  unclonable  6.48727e-06 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  32.41 
 
 
460 aa  223  5e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  32.41 
 
 
460 aa  223  5e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.46324e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  32.21 
 
 
460 aa  221  2e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  35.89 
 
 
393 aa  221  3e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  32.61 
 
 
460 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  3.32347e-07  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  32.19 
 
 
460 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  32.08 
 
 
460 aa  216  6e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.00121e-05  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  32.08 
 
 
460 aa  216  6e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.44468e-08  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  34.53 
 
 
560 aa  215  1e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  32.61 
 
 
460 aa  215  2e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  31.86 
 
 
454 aa  210  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  30.33 
 
 
493 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  33.9 
 
 
638 aa  207  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  31.8 
 
 
460 aa  206  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  7.25469e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  32.6 
 
 
460 aa  206  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  32.16 
 
 
460 aa  205  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  28.44 
 
 
779 aa  193  5e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  30.66 
 
 
466 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142.3  Na(+)/H(+) antiporter  80.83 
 
 
120 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  29.71 
 
 
448 aa  187  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.21 
 
 
594 aa  185  1e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>