More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2476 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
112 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  67.57 
 
 
132 aa  160  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  71.43 
 
 
143 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  71.43 
 
 
138 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  70.41 
 
 
138 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  69.61 
 
 
132 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  68.32 
 
 
138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  68.63 
 
 
132 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  68.63 
 
 
132 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  57.14 
 
 
127 aa  138  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  52.68 
 
 
125 aa  124  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  49.53 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  49.12 
 
 
129 aa  117  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  50.89 
 
 
132 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
128 aa  110  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  52.13 
 
 
136 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  43.48 
 
 
116 aa  97.1  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  48.89 
 
 
116 aa  93.6  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  46.39 
 
 
123 aa  92.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  43.56 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  40.7 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  45.95 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  41.57 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  45.12 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  37.86 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  43.02 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  41.25 
 
 
119 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  49.4 
 
 
188 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  49.33 
 
 
565 aa  71.6  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  43.48 
 
 
123 aa  72  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  45.12 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  37.63 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  37.37 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  35.96 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  38.37 
 
 
108 aa  67  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 
107 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 
464 aa  67  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  42.53 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  43.04 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  41.1 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  43.66 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  44.64 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  43.94 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  49.23 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  41.05 
 
 
220 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  42.68 
 
 
216 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 
124 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3904  rhodanese domain-containing protein  33.71 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089939  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  42.65 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  36.9 
 
 
116 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  38.27 
 
 
98 aa  61.6  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  40.51 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1810  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.49 
 
 
104 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000312161 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  38.82 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1872  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.49 
 
 
103 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0100112 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  34.02 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  34.02 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  34.02 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  34.02 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 
122 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  34.02 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  34.02 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.49 
 
 
104 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1464  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.49 
 
 
104 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  34.02 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1646  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.49 
 
 
104 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604972 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  39.39 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  40.54 
 
 
480 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  43.06 
 
 
132 aa  60.1  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.65 
 
 
478 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  42.65 
 
 
484 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.65 
 
 
478 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.65 
 
 
478 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  32.69 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  32.69 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  47.76 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  41.57 
 
 
480 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  42.65 
 
 
484 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  42.65 
 
 
478 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0930  hypothetical protein  43.48 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0119442  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0541  hypothetical protein  34.15 
 
 
598 aa  58.9  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.360191  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  38.57 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1398  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.2 
 
 
554 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00125379  normal  0.336053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>