More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2341 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 764 aa  1570    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  34.1 
 
 		 762 aa  372  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 737 aa  369  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 742 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 736 aa  340  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 742 aa  335  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 719 aa  306  7e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 761 aa  200  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2999  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 778 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0477  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 778 aa  168  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.642633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3037  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 778 aa  168  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000978239  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0146  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 778 aa  168  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580852  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 784 aa  168  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2630  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 778 aa  168  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1000  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 778 aa  168  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2935  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 778 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0458457  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 784 aa  164  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  23.34 
 
 		 794 aa  157  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 804 aa  156  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  23.67 
 
 		 779 aa  154  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1598  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 778 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0220938  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2388  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 788 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 772 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 772 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0635  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 874 aa  140  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 782 aa  137  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 743 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 788 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 699 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0532  hypothetical protein  25.79 
 
 		 790 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203812  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1010  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 790 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0114301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0970  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 786 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108903  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 821 aa  125  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 815 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 705 aa  120  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  29.13 
 
 		 807 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 796 aa  120  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 828 aa  119  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 698 aa  118  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 836 aa  115  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  28.2 
 
 		 663 aa  112  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  28.04 
 
 		 666 aa  111  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  27.91 
 
 		 663 aa  110  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 828 aa  110  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  28.04 
 
 		 666 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  27.78 
 
 		 666 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  27.78 
 
 		 666 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.85 
 
 		 715 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 845 aa  106  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  27.1 
 
 		 666 aa  105  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 760 aa  104  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2882  TonB-dependent receptor protein  26.72 
 
 		 780 aa  104  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00344491  hitchhiker  0.00617905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4255  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 720 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  23.45 
 
 		 706 aa  100  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  23.11 
 
 		 757 aa  100  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  30.26 
 
 		 631 aa  99.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 		 849 aa  99.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.95 
 
 		 861 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 726 aa  99  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 613 aa  99  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 698 aa  99  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 698 aa  99  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 698 aa  99  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  35.51 
 
 		 665 aa  97.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  26.01 
 
 		 652 aa  96.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  34.98 
 
 		 634 aa  97.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 702 aa  96.3  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 652 aa  94.7  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  35.64 
 
 		 698 aa  94.7  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 648 aa  94.4  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0676  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 732 aa  94  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.218893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 649 aa  94  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 		 627 aa  92.8  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  38.01 
 
 		 631 aa  92.4  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 614 aa  92.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  38.01 
 
 		 631 aa  92  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  41.3 
 
 		 663 aa  92  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  41.3 
 
 		 663 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  41.3 
 
 		 663 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  41.3 
 
 		 663 aa  92  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  41.3 
 
 		 663 aa  92  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  41.3 
 
 		 663 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  41.3 
 
 		 659 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  41.3 
 
 		 641 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  26.38 
 
 		 712 aa  91.7  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 662 aa  91.3  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.46 
 
 		 1023 aa  90.5  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 680 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  39.57 
 
 		 650 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  39.57 
 
 		 650 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  39.57 
 
 		 650 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  39.57 
 
 		 650 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 657 aa  89.7  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 731 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  39.57 
 
 		 650 aa  90.1  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  36.94 
 
 		 602 aa  89  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1412  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 399 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 662 aa  89.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 804 aa  89  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 875 aa  89  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>