More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2301 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  217  4e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.77847e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  99.08 
 
 
111 aa  216  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.93048e-08  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  98.17 
 
 
121 aa  214  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.12761e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  98.17 
 
 
121 aa  214  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  2.45202e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  98.17 
 
 
111 aa  215  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.51444e-07  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  98.17 
 
 
121 aa  214  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.29424e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  98.17 
 
 
109 aa  214  3e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.05784e-10  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2445  hypothetical protein  97.25 
 
 
111 aa  212  2e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  7.75754e-08  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2014  hypothetical protein  97.25 
 
 
109 aa  210  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  91.74 
 
 
109 aa  206  7e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  3.97187e-05  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  89.91 
 
 
109 aa  202  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  8.46885e-08  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  88.99 
 
 
109 aa  201  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.38787e-08  hitchhiker  1.17364e-07 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  91.82 
 
 
110 aa  202  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  8.06852e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  88.99 
 
 
109 aa  200  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  4.44013e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  88.07 
 
 
109 aa  200  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.48364e-08  hitchhiker  2.68908e-07 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  91.82 
 
 
110 aa  199  1e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  5.26111e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  83.49 
 
 
109 aa  187  6e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  83.49 
 
 
120 aa  187  6e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  6.10964e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  82.57 
 
 
109 aa  186  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  80.73 
 
 
109 aa  183  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  80.73 
 
 
109 aa  182  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  80.73 
 
 
109 aa  182  1e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  80.73 
 
 
109 aa  182  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  80.73 
 
 
109 aa  182  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  80.73 
 
 
109 aa  182  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  80.73 
 
 
109 aa  182  1e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  80.73 
 
 
109 aa  182  1e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  80.73 
 
 
109 aa  182  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  80.73 
 
 
109 aa  182  1e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  80.73 
 
 
109 aa  182  1e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  80.73 
 
 
109 aa  182  1e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  80.73 
 
 
109 aa  182  1e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  80.73 
 
 
109 aa  182  1e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  78.9 
 
 
109 aa  174  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  79.28 
 
 
111 aa  173  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  76.15 
 
 
109 aa  172  1e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  2.43937e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  77.06 
 
 
109 aa  170  6e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  77.36 
 
 
108 aa  169  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  72.64 
 
 
108 aa  158  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0951  hypothetical protein  76.77 
 
 
110 aa  158  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0862598  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  72.48 
 
 
109 aa  155  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1136  hypothetical protein  78.9 
 
 
109 aa  154  5e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226792  unclonable  1.4815e-08 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3234  hypothetical protein  78.9 
 
 
109 aa  152  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  9.25848e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1077  hypothetical protein  78.9 
 
 
109 aa  152  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  69.23 
 
 
106 aa  150  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  66.98 
 
 
108 aa  150  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  66.04 
 
 
108 aa  149  9e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2890  hypothetical protein  78.18 
 
 
110 aa  149  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490334 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3058  hypothetical protein  78.18 
 
 
110 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3197  hypothetical protein  78.18 
 
 
110 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.613277  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  66.67 
 
 
109 aa  149  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  67.92 
 
 
108 aa  148  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  67.92 
 
 
111 aa  148  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2896  hypothetical protein  71.72 
 
 
99 aa  148  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825896  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19840  hypothetical protein  68.87 
 
 
108 aa  148  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  69.72 
 
 
108 aa  147  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  66.98 
 
 
108 aa  147  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  66.98 
 
 
108 aa  147  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3645  hypothetical protein  66.98 
 
 
108 aa  147  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  65.09 
 
 
108 aa  144  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  66.97 
 
 
111 aa  143  7e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  65.09 
 
 
107 aa  142  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  66.06 
 
 
111 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  66.04 
 
 
108 aa  141  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  66.06 
 
 
111 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  66.06 
 
 
111 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  57.55 
 
 
107 aa  135  3e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  61.32 
 
 
108 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  61.32 
 
 
108 aa  134  6e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  61.32 
 
 
108 aa  134  6e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  61.32 
 
 
108 aa  133  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  61.32 
 
 
108 aa  133  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  61.32 
 
 
108 aa  133  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  61.32 
 
 
108 aa  133  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  60 
 
 
110 aa  132  2e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2243  hypothetical protein  61.32 
 
 
108 aa  131  2e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0461553  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1360  hypothetical protein  61.32 
 
 
108 aa  131  2e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2205  hypothetical protein  61.32 
 
 
108 aa  131  2e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0750998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1850  hypothetical protein  61.32 
 
 
108 aa  131  2e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00325862  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  61.32 
 
 
108 aa  132  2e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  61.32 
 
 
108 aa  131  2e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  61.32 
 
 
108 aa  131  2e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  61.32 
 
 
108 aa  132  2e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  61.32 
 
 
108 aa  131  2e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1573  hypothetical protein  56.6 
 
 
108 aa  131  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0202181  hitchhiker  2.55943e-06 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2360  hypothetical protein  61.32 
 
 
108 aa  130  4e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0900418  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1827  hypothetical protein  61.32 
 
 
108 aa  130  4e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.878322  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  59.43 
 
 
108 aa  130  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1612  hypothetical protein  67.62 
 
 
107 aa  129  1e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.062736  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  58.49 
 
 
108 aa  129  1e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  58.49 
 
 
108 aa  129  1e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  63.21 
 
 
107 aa  129  1e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  9.27658e-07 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1400  hypothetical protein  59.43 
 
 
107 aa  128  2e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1458  hypothetical protein  60 
 
 
110 aa  129  2e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.542371  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2645  hypothetical protein  59.09 
 
 
110 aa  129  2e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439109 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2533  hypothetical protein  58.49 
 
 
108 aa  129  2e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.180603  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  59.43 
 
 
106 aa  127  5e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2349  hypothetical protein  59.09 
 
 
110 aa  127  5e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1508  hypothetical protein  59.09 
 
 
110 aa  127  5e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  58.88 
 
 
107 aa  126  9e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>