78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2234 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2234  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  414  1e-115  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2472  hypothetical protein  97.56 
 
 
205 aa  405  1e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.27559e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2479  hypothetical protein  97.07 
 
 
205 aa  405  1e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000487251  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1872  hypothetical protein  97.56 
 
 
205 aa  405  1e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  3.37406e-05  hitchhiker  9.47972e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2592  hypothetical protein  97.07 
 
 
205 aa  405  1e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00225749  normal  0.0485502 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1677  hypothetical protein  90.73 
 
 
205 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260376  normal  0.117639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1602  hypothetical protein  90.24 
 
 
205 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00444605  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1746  hypothetical protein  89.27 
 
 
205 aa  377  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2634  hypothetical protein  88.29 
 
 
205 aa  367  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1559  hypothetical protein  77.07 
 
 
205 aa  333  9e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  9.60005e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2063  hypothetical protein  77.72 
 
 
204 aa  323  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  4.21007e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1880  hypothetical protein  75.61 
 
 
204 aa  322  3e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.29712e-07 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2261  hypothetical protein  79.8 
 
 
210 aa  321  5e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2539  hypothetical protein  72.68 
 
 
205 aa  320  1e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2706  hypothetical protein  76.59 
 
 
204 aa  319  2e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0532823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1827  hypothetical protein  76.24 
 
 
211 aa  315  4e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2196  hypothetical protein  49.5 
 
 
205 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02369  hypothetical protein  51.74 
 
 
208 aa  204  7e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0518841  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003856  hypothetical protein  49 
 
 
205 aa  202  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.489271  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01823  hypothetical protein  48 
 
 
205 aa  198  4e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0645  hypothetical protein  47 
 
 
205 aa  197  6e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0962  hypothetical protein  47.74 
 
 
209 aa  192  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2380  hypothetical protein  46.57 
 
 
219 aa  192  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.386361  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2901  hypothetical protein  46.34 
 
 
211 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.549954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1719  hypothetical protein  46.19 
 
 
208 aa  172  4e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2852  hypothetical protein  46.19 
 
 
208 aa  172  4e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.954826 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1611  hypothetical protein  46.19 
 
 
208 aa  172  4e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2153  hypothetical protein  46.46 
 
 
212 aa  164  1e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0117642  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1868  hypothetical protein  45.96 
 
 
212 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1993  hypothetical protein  42.72 
 
 
213 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.934433 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2515  protein of unknown function DUF489  42.72 
 
 
213 aa  158  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0030119  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2471  hypothetical protein  42.72 
 
 
213 aa  158  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01138  hypothetical protein  42.72 
 
 
213 aa  158  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.442893  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1295  hypothetical protein  42.72 
 
 
213 aa  158  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1252  hypothetical protein  42.72 
 
 
213 aa  158  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01130  hypothetical protein  42.72 
 
 
213 aa  158  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1593  hypothetical protein  42.23 
 
 
213 aa  156  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  9.89922e-05 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1594  hypothetical protein  44.33 
 
 
203 aa  156  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1310  hypothetical protein  42.23 
 
 
213 aa  156  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2133  hypothetical protein  41.26 
 
 
213 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0109581 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1951  hypothetical protein  41.26 
 
 
213 aa  155  5e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1312  hypothetical protein  42.42 
 
 
215 aa  155  5e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.429875  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1334  hypothetical protein  41.26 
 
 
213 aa  155  5e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1350  hypothetical protein  41.26 
 
 
213 aa  155  5e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1763  hypothetical protein  40.49 
 
 
206 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.173363  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1645  hypothetical protein  40.29 
 
 
209 aa  148  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2021  hypothetical protein  39.69 
 
 
208 aa  147  1e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.265871 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1941  hypothetical protein  40.91 
 
 
210 aa  142  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2064  hypothetical protein  36.89 
 
 
209 aa  141  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.890726  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1267  protein of unknown function DUF489  39.69 
 
 
209 aa  140  1e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2041  hypothetical protein  40.21 
 
 
213 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3359  hypothetical protein  38.89 
 
 
206 aa  133  1e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00274123  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3597  hypothetical protein  39.36 
 
 
207 aa  131  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3191  hypothetical protein  38.58 
 
 
206 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.140905 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1676  hypothetical protein  37.84 
 
 
209 aa  131  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2400  hypothetical protein  36.89 
 
 
206 aa  131  7e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00786814  normal  0.0777088 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30140  hypothetical protein  39.06 
 
 
206 aa  131  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28370  hypothetical protein  39.39 
 
 
207 aa  129  2e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4015  hypothetical protein  37.69 
 
 
208 aa  130  2e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1818  hypothetical protein  37.69 
 
 
208 aa  130  2e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.112732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3419  hypothetical protein  37.69 
 
 
208 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.915655 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3620  hypothetical protein  37.69 
 
 
208 aa  128  5e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714813  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2580  hypothetical protein  39.78 
 
 
206 aa  127  9e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3266  hypothetical protein  34.98 
 
 
209 aa  126  2e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.00595e-05 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1098  hypothetical protein  34.34 
 
 
228 aa  126  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0201  hypothetical protein  35.47 
 
 
207 aa  126  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0760616  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1918  hypothetical protein  34.15 
 
 
204 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.32304 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1452  hypothetical protein  33.67 
 
 
205 aa  122  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06141  hypothetical protein  33.33 
 
 
200 aa  119  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01025  hypothetical protein  33.33 
 
 
200 aa  119  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1843  hypothetical protein  36.46 
 
 
227 aa  117  1e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2445  hypothetical protein  33.5 
 
 
214 aa  111  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0782  hypothetical protein  31.86 
 
 
204 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0695  hypothetical protein  30.88 
 
 
204 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.596389  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0923  hypothetical protein  30.96 
 
 
221 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1042  hypothetical protein  30.96 
 
 
221 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125436 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1405  hypothetical protein  30.77 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1949  protein of unknown function DUF489  29.65 
 
 
209 aa  91.7  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>