More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2107 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  100 
 
 
303 aa  617  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  90.43 
 
 
303 aa  560  1e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  90.43 
 
 
303 aa  563  1e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  91.09 
 
 
303 aa  547  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  91.09 
 
 
303 aa  547  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  90.1 
 
 
303 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  88.12 
 
 
303 aa  529  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  88.45 
 
 
303 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  89.47 
 
 
313 aa  528  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  88.45 
 
 
303 aa  530  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  77.18 
 
 
303 aa  474  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  75.99 
 
 
303 aa  475  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  74.59 
 
 
303 aa  464  1e-130  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  74.83 
 
 
303 aa  463  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  73.49 
 
 
309 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  72.28 
 
 
303 aa  441  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  71.38 
 
 
315 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  60.26 
 
 
305 aa  352  4e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  63.25 
 
 
312 aa  348  7e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  57.05 
 
 
315 aa  341  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  57.09 
 
 
303 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2778  hypothetical protein  53.37 
 
 
350 aa  335  5e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  62.14 
 
 
305 aa  331  8e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  56.55 
 
 
308 aa  330  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  61.79 
 
 
305 aa  328  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  53.72 
 
 
315 aa  328  8e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  56.68 
 
 
306 aa  328  9e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  57 
 
 
308 aa  327  2e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  54.85 
 
 
306 aa  326  3e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.21 
 
 
317 aa  321  8e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  58.48 
 
 
305 aa  321  8e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.45 
 
 
331 aa  321  1e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.2 
 
 
300 aa  320  2e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0353167  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  60.14 
 
 
305 aa  320  2e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  57.53 
 
 
321 aa  318  5e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  59.51 
 
 
305 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  59.15 
 
 
305 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.7 
 
 
323 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.7 
 
 
323 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  57.6 
 
 
303 aa  316  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  54.27 
 
 
317 aa  313  2e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  53.56 
 
 
302 aa  313  3e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  53.92 
 
 
317 aa  311  8e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  55.68 
 
 
306 aa  310  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  58.82 
 
 
317 aa  311  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  52.68 
 
 
306 aa  309  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.68 
 
 
306 aa  308  7e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  52.61 
 
 
335 aa  308  8e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  52.13 
 
 
335 aa  305  6e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.22 
 
 
329 aa  305  6e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  57.25 
 
 
315 aa  303  2e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  53.26 
 
 
306 aa  303  3e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  51.35 
 
 
306 aa  301  7e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  56.48 
 
 
315 aa  300  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  56.16 
 
 
306 aa  297  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  52.9 
 
 
306 aa  296  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
305 aa  295  5e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  54.95 
 
 
310 aa  295  7e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.67 
 
 
313 aa  295  7e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  53.33 
 
 
310 aa  294  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  53.74 
 
 
304 aa  293  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0095  MoxR protein  54.89 
 
 
317 aa  293  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.05 
 
 
319 aa  293  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  50.72 
 
 
347 aa  293  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.07 
 
 
306 aa  292  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  55.07 
 
 
306 aa  292  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  53.38 
 
 
304 aa  292  4e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1323  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.82 
 
 
308 aa  287  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.167846  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  44.19 
 
 
318 aa  285  8e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  47.57 
 
 
323 aa  284  1e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  47.99 
 
 
310 aa  284  1e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.81 
 
 
325 aa  282  5e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  48.65 
 
 
302 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.14 
 
 
330 aa  280  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  47.33 
 
 
305 aa  280  2e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  44.71 
 
 
314 aa  280  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  47.6 
 
 
327 aa  279  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.5 
 
 
327 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  44.93 
 
 
302 aa  277  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  45.27 
 
 
320 aa  277  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.26 
 
 
325 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  47.33 
 
 
305 aa  276  4e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  44.93 
 
 
320 aa  275  5e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  49.48 
 
 
328 aa  275  8e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  53.21 
 
 
349 aa  274  1e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  46.32 
 
 
320 aa  273  2e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.13 
 
 
302 aa  274  2e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4014  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.67 
 
 
312 aa  273  2e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.35 
 
 
322 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  49.46 
 
 
310 aa  272  4e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45 
 
 
316 aa  272  4e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.48 
 
 
318 aa  272  5e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  44.4 
 
 
308 aa  271  7e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.94 
 
 
341 aa  271  9e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  45.8 
 
 
320 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0634  ATPase  44.3 
 
 
324 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  3.06223e-06  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  45.8 
 
 
320 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  45.8 
 
 
320 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  49.82 
 
 
359 aa  269  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  45.45 
 
 
320 aa  269  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>