61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2055 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 369 aa  767    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  72.68 
 
 		 392 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  73.1 
 
 		 377 aa  551  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  73.5 
 
 		 378 aa  549  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  73.64 
 
 		 378 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  48.35 
 
 		 362 aa  346  4e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  50.48 
 
 		 580 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.26 
 
 		 648 aa  332  5e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.35 
 
 		 316 aa  323  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.49 
 
 		 315 aa  316  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.5 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.17 
 
 		 315 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.51 
 
 		 505 aa  306  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  47.44 
 
 		 316 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  47.44 
 
 		 316 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  47.44 
 
 		 316 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.37 
 
 		 314 aa  302  7.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  47.12 
 
 		 316 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  47.12 
 
 		 316 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.76 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.56 
 
 		 426 aa  298  8e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  45.34 
 
 		 344 aa  276  4e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  44.31 
 
 		 333 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.38 
 
 		 333 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.38 
 
 		 333 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  42.72 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  43.69 
 
 		 341 aa  262  8e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.31 
 
 		 350 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.33 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.56 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.33 
 
 		 355 aa  156  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.35 
 
 		 347 aa  152  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  32.34 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.21 
 
 		 507 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.12 
 
 		 466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  30.03 
 
 		 2073 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.87 
 
 		 628 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.57 
 
 		 607 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  28.39 
 
 		 634 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.97 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  28.06 
 
 		 634 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  28.06 
 
 		 634 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  27.79 
 
 		 627 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  30.7 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  32.8 
 
 		 349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.35 
 
 		 517 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  31.54 
 
 		 502 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  27.89 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  25.89 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  25.88 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  27.51 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25.81 
 
 		 495 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  25 
 
 		 710 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  29.07 
 
 		 340 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  23.56 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  26.27 
 
 		 713 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  29.32 
 
 		 465 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  24.6 
 
 		 512 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  24.58 
 
 		 331 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  24.7 
 
 		 472 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  24.14 
 
 		 345 aa  42.7  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>