249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1920 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  100 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  90.31 
 
 		 227 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  90.31 
 
 		 227 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  89.87 
 
 		 227 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  88.99 
 
 		 227 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1879  hemolysin III family channel protein  81.5 
 
 		 227 aa  339  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2099  hemolysin III family channel protein  81.06 
 
 		 227 aa  337  8e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0169079  normal  0.972179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1934  hemolysin III family channel protein  80.18 
 
 		 227 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.680237  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2447  hemolysin III family channel protein  84.47 
 
 		 217 aa  317  7.999999999999999e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  68.28 
 
 		 226 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  64.5 
 
 		 236 aa  293  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  65.35 
 
 		 226 aa  291  6e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1873  channel protein, hemolysin III family protein  65.49 
 
 		 227 aa  287  9e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  69.82 
 
 		 249 aa  285  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  53.81 
 
 		 241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1768  hemolysin III family channel protein  56.84 
 
 		 235 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000462203  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  50.45 
 
 		 233 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  53.69 
 
 		 217 aa  215  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  53.3 
 
 		 215 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  55.34 
 
 		 218 aa  211  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  53.62 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  52.8 
 
 		 216 aa  210  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  52.91 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  52.91 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  52.91 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  52.91 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  52.91 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  52.91 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  52.91 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  52.91 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  52.91 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  50 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  50.47 
 
 		 215 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  52.43 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  52.43 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  52.43 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  52.43 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  52.43 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  49.53 
 
 		 215 aa  201  7e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  49.03 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03143  putative hemolysin III  46.82 
 
 		 218 aa  194  7e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  53.4 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  45.75 
 
 		 218 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  45.79 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  46.05 
 
 		 218 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  43.69 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3838  hemolysin III family protein  49.33 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.69609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  47.25 
 
 		 216 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0870  hemolysin III family protein  49.33 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0873  hemolysin III family channel protein  49.33 
 
 		 233 aa  188  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  45.12 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  45.12 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  45.12 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  45.12 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  45.12 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  45.12 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  45.12 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  45.12 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0720  hemolysin III  45.37 
 
 		 219 aa  182  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  45.15 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  45.1 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  44.44 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1732  channel protein, hemolysin III family  45.89 
 
 		 214 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  45.69 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  41.09 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  39.91 
 
 		 227 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  42.52 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  41.31 
 
 		 214 aa  171  7.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  39.65 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  41.38 
 
 		 216 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  40.2 
 
 		 209 aa  162  6e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  42.58 
 
 		 217 aa  159  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  39 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  39 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1550  channel protein, hemolysin III family  37.62 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561476  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  41.26 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  39.81 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3326  hemolysin III family channel protein  42.08 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  34.89 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  36.71 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  39.8 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  34.7 
 
 		 230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  38.81 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0520  hemolysin like protein  36.77 
 
 		 217 aa  141  7e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  42.23 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0661  Hly-III related proteins  38.76 
 
 		 212 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1076  hemolysin III family channel protein  41.38 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  41.26 
 
 		 205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  39.41 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  36.59 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0909  hemolysin III-like protein  35.35 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0525  hypothetical protein  38.31 
 
 		 219 aa  131  9e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2177  Hly-III family protein  38.31 
 
 		 219 aa  131  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00438954  normal  0.0630884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  37.81 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  39.22 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  39.22 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0042  channel protein, hemolysin III family  39.61 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  38.5 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  38.24 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  38.24 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>