164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1842 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2196  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  83.29 
 
 
389 aa  698  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00896823  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2341  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  77.78 
 
 
389 aa  659  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  7.53672e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1899  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  83.03 
 
 
389 aa  699  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315417  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2076  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  83.29 
 
 
389 aa  696  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2134  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  77.78 
 
 
389 aa  659  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.674924  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1842  peptidase  100 
 
 
389 aa  800  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  9.983e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2122  PepSY-associated TM helix domain protein  78.29 
 
 
389 aa  660  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  2.05192e-07  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  63.02 
 
 
390 aa  534  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  40.05 
 
 
398 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  38.73 
 
 
399 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  38.61 
 
 
403 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  38.13 
 
 
403 aa  269  6e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  38.5 
 
 
407 aa  266  3e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2145  iron-regulated membrane protein, putative  38.12 
 
 
411 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.970349  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  36.68 
 
 
397 aa  246  5e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  36.41 
 
 
397 aa  246  5e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  36.15 
 
 
397 aa  244  1e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  35.83 
 
 
397 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2394  PepSY-associated TM helix  35.85 
 
 
393 aa  214  2e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.320508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1143  PepSY-associated TM helix  30.86 
 
 
377 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  30.75 
 
 
396 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3065  PepSY-associated TM helix  25.36 
 
 
366 aa  103  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.5229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  25.56 
 
 
380 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  24.32 
 
 
361 aa  96.7  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.07 
 
 
376 aa  92  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  23.34 
 
 
356 aa  89.7  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  26.67 
 
 
444 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1573  PepSY-associated TM helix domain protein  25.36 
 
 
351 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0338986 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1718  PepSY-associated TM helix family protein  21.23 
 
 
366 aa  85.5  1e-15  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2723  putative iron-regulated membrane protein  25.87 
 
 
372 aa  82  2e-14  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0872  putative iron-regulated membrane protein  21.33 
 
 
348 aa  81.3  3e-14  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.3 
 
 
409 aa  79.3  1e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0909277  normal  0.103498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.14 
 
 
386 aa  78.6  2e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.40307e-14 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.81 
 
 
374 aa  78.6  2e-13  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.89 
 
 
369 aa  75.9  1e-12  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  20.92 
 
 
371 aa  75.9  1e-12  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  1.07193e-05 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.7 
 
 
385 aa  75.1  2e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0607  PepSY-associated TM helix domain protein  24.94 
 
 
408 aa  74.3  3e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.861518  normal  0.0104892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  25.58 
 
 
406 aa  72.8  1e-11  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  22.74 
 
 
382 aa  71.6  2e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  23.06 
 
 
394 aa  71.6  2e-11  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0337  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.1 
 
 
412 aa  70.9  3e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0226  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.61 
 
 
412 aa  71.2  3e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0244  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.09 
 
 
412 aa  70.5  4e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.88 
 
 
382 aa  70.5  4e-11  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  26.72 
 
 
385 aa  70.1  6e-11  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.94 
 
 
387 aa  69.7  8e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  22.64 
 
 
381 aa  69.7  9e-11  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  23.33 
 
 
497 aa  68.9  1e-10  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3375  hypothetical protein  23.62 
 
 
383 aa  68.9  1e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0248134  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  22.56 
 
 
377 aa  69.3  1e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4111  hypothetical protein  23.17 
 
 
408 aa  69.3  1e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911346  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  24.59 
 
 
371 aa  69.3  1e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2081  PepSY-associated TM helix domain protein  23.21 
 
 
381 aa  68.9  1e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  23.34 
 
 
502 aa  68.2  2e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2514  PepSY-associated TM helix domain protein  24.74 
 
 
437 aa  68.6  2e-10  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  21.97 
 
 
377 aa  67.8  3e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  23.4 
 
 
411 aa  68.2  3e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39830  hypothetical protein  23.12 
 
 
383 aa  67.4  4e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123723  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.47 
 
 
369 aa  67.4  4e-10  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  23.26 
 
 
408 aa  67  6e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.07 
 
 
526 aa  65.9  1e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.43 
 
 
405 aa  65.9  1e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1123  PepSY-associated TM helix domain protein  21.36 
 
 
396 aa  65.1  2e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  22.28 
 
 
627 aa  65.1  2e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.83 
 
 
892 aa  64.7  3e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  22.39 
 
 
385 aa  64.7  3e-09  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 
1117 aa  63.9  4e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5344  PepSY-associated TM helix domain protein  22.74 
 
 
391 aa  64.3  4e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  24.31 
 
 
641 aa  63.9  4e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4555  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.33 
 
 
403 aa  63.5  5e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  21.68 
 
 
459 aa  63.5  6e-09  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  22.62 
 
 
391 aa  63.2  7e-09  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.26 
 
 
525 aa  62.4  1e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  24.74 
 
 
393 aa  62.4  1e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.13 
 
 
525 aa  62.4  1e-08  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  24.37 
 
 
410 aa  61.6  2e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5190  PepSY-associated TM helix  23.47 
 
 
376 aa  61.6  2e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1435  PepSY-associated membrane protein  22.58 
 
 
376 aa  61.6  2e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  21.67 
 
 
381 aa  60.8  3e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  22.93 
 
 
496 aa  61.2  3e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  24.51 
 
 
470 aa  61.2  3e-08  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0433  PepSY-associated TM helix domain protein  23.24 
 
 
433 aa  60.5  5e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  22.77 
 
 
425 aa  60.1  7e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1148  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.35 
 
 
560 aa  59.3  1e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0377  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.2 
 
 
370 aa  58.9  1e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1218  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.91 
 
 
560 aa  59.3  1e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.16 
 
 
501 aa  57.8  3e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.31 
 
 
575 aa  57.8  3e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3077  PepSY-associated TM helix domain protein  24.15 
 
 
565 aa  57.8  3e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25320  membrane protein  22.08 
 
 
524 aa  57.8  3e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.49 
 
 
554 aa  57.4  4e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1313  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.31 
 
 
575 aa  57.4  4e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753678  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  26.17 
 
 
397 aa  57.8  4e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.94 
 
 
370 aa  57.8  4e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301587  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0349  PepSY-associated TM helix domain protein  23.91 
 
 
370 aa  57.4  4e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472223  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0817  PepSY-associated TM helix domain protein  23.02 
 
 
393 aa  57.4  4e-07  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.09 
 
 
560 aa  57  5e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366711  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  23.35 
 
 
381 aa  57.4  5e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2069  PepSY-associated TM helix domain protein  22.34 
 
 
397 aa  56.6  8e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>