217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1696 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1696  SirA family protein  100 
 
 		 77 aa  154  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  76.62 
 
 		 77 aa  123  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  76.62 
 
 		 77 aa  123  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  76.62 
 
 		 77 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1828  SirA family protein  79.22 
 
 		 77 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.263187  normal  0.225214 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2494  SirA family protein  79.22 
 
 		 77 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1784  SirA family protein  79.22 
 
 		 77 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832592  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1791  SirA family protein  79.22 
 
 		 77 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  73.68 
 
 		 77 aa  116  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1912  hypothetical protein  61.11 
 
 		 76 aa  92.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1756  SirA family protein  57.53 
 
 		 73 aa  87.8  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2170  SirA family protein  58.33 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1972  SirA family protein  54.93 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1648  hypothetical protein  54.17 
 
 		 72 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.282998  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2436  SirA family protein  53.62 
 
 		 76 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512226 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1842  SirA family protein  47.95 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.483322  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  42.65 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  35.29 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  36.36 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  30.88 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  30.43 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  30.88 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  30.43 
 
 		 75 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  36.67 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  38.46 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  26.47 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  38.36 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  37.5 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  27.94 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  38.46 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  37.7 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  30.88 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  30.88 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  30.88 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  30.88 
 
 		 75 aa  50.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  30.88 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  36.23 
 
 		 80 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  30.88 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2083  SirA family protein  40.98 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  29.41 
 
 		 76 aa  50.4  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  35.21 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  34.62 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  28.17 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  46.15 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  36.07 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  36.51 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  36.51 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  36.51 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  36.51 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  38 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3688  SirA-like  33.8 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  37.29 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  40.38 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  37.29 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  30 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  34.62 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  34.62 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  34.62 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  34.62 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  34.62 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  34.62 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  34.62 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  31.43 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  34.62 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  34.62 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  34.62 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  34.62 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  34.62 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  34.62 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  34.62 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  27.94 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  36.62 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  32.35 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  34.62 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  36.62 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  36.54 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  36.54 
 
 		 201 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  28.17 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  29.41 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2086  SirA family protein  34.29 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  30.88 
 
 		 213 aa  47.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6347  hypothetical protein  31.82 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341476  normal  0.150375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  33.33 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  30.43 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3493  SirA-like  31.43 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  36.54 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  33.33 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  30.77 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  32.69 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1873  SirA-like  31.43 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265759  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  34 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  40 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  34 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  32.69 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  30.88 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  30.88 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  34.62 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  34.62 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  38 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  34 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>