More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1660 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  87.1 
 
 
744 aa  1346  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  2.23864e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  74.08 
 
 
733 aa  1142  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  72.53 
 
 
736 aa  1109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  64.67 
 
 
744 aa  956  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  73.32 
 
 
712 aa  1081  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  2.26653e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  78.66 
 
 
757 aa  1196  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  67.48 
 
 
730 aa  1047  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  88.96 
 
 
743 aa  1378  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  91.21 
 
 
743 aa  1377  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  73.67 
 
 
713 aa  1107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  100 
 
 
729 aa  1505  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  7.50921e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  78.8 
 
 
748 aa  1199  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  88.98 
 
 
744 aa  1375  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  5.83553e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  91.67 
 
 
732 aa  1399  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  71.51 
 
 
729 aa  1085  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  94.32 
 
 
733 aa  1361  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  41.75 
 
 
697 aa  519  1e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  38.72 
 
 
726 aa  491  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1344  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 
687 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341297  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  34.59 
 
 
714 aa  398  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02805  TonB-dependent receptor  34.22 
 
 
696 aa  353  7e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00354555  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 
690 aa  226  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 
853 aa  223  1e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 
690 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 
851 aa  219  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 
720 aa  205  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 
695 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.51 
 
 
715 aa  185  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 
729 aa  185  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 
687 aa  181  5e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 
720 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 
783 aa  177  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 
732 aa  176  1e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 
747 aa  173  8e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 
713 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 
764 aa  170  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 
712 aa  169  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 
728 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 
763 aa  168  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 
734 aa  165  2e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 
686 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 
704 aa  162  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 
755 aa  162  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 
702 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  5.40128e-05  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 
794 aa  160  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 
759 aa  160  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 
710 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 
753 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 
773 aa  158  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 
737 aa  155  3e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 
749 aa  155  3e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  3.58025e-10  decreased coverage  1.02915e-05 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 
763 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  1.21747e-10  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 
700 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 
641 aa  152  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 
767 aa  151  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.83 
 
 
755 aa  150  1e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 
753 aa  150  1e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 
769 aa  149  2e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24 
 
 
695 aa  148  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  8.98905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 
731 aa  148  4e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 
761 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 
771 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 
710 aa  147  8e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 
775 aa  147  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 
670 aa  146  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 
723 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 
762 aa  145  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 
741 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 
694 aa  145  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 
732 aa  145  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 
692 aa  144  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 
773 aa  144  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 
730 aa  144  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  3.66625e-11  decreased coverage  7.30384e-05 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 
769 aa  143  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 
741 aa  143  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 
771 aa  143  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 
761 aa  143  1e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 
750 aa  142  2e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 
726 aa  142  2e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 
771 aa  142  2e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 
743 aa  142  2e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 
767 aa  141  4e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 
711 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 
746 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 
773 aa  140  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 
666 aa  139  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  23.88 
 
 
799 aa  139  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 
803 aa  139  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  24.91 
 
 
751 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  2.21173e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 
759 aa  139  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 
761 aa  139  3e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 
738 aa  138  3e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 
733 aa  139  3e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 
712 aa  138  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 
764 aa  138  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  3.45148e-11  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 
736 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 
743 aa  137  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 
779 aa  137  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 
809 aa  136  1e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 
694 aa  137  1e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>