More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1642 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1642  ABC transporter related  100 
 
 		 308 aa  626  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00844741  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1800  ABC transporter related  80.52 
 
 		 303 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.72569 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2522  ABC transporter related  80.52 
 
 		 303 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.575143  normal  0.64922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1756  ABC transporter related  80.84 
 
 		 303 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55189  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1763  ABC transporter related  80.52 
 
 		 303 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.842524  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  77.02 
 
 		 302 aa  488  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  76.38 
 
 		 302 aa  484  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  76.38 
 
 		 302 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  75.08 
 
 		 302 aa  475  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2484  ABC transporter related  66.88 
 
 		 301 aa  424  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.013646  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2613  ABC transporter-related protein  61.36 
 
 		 299 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1694  ABC transporter related  60.71 
 
 		 299 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2053  ABC transporter related  59.74 
 
 		 299 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0394425  normal  0.0287688 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1615  ABC transporter-related protein  61.69 
 
 		 301 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.183501  hitchhiker  0.00912591 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2284  ABC transporter related  58.44 
 
 		 298 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.564058  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1969  ABC transporter, ATP-binding protein  55.66 
 
 		 301 aa  340  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0565682  normal  0.106232 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  35.14 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1172  ABC transporter related  40.74 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  30.8 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0053  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.43 
 
 		 301 aa  159  8e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  40 
 
 		 301 aa  159  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  35.8 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  37.62 
 
 		 240 aa  153  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  42.58 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  35.85 
 
 		 315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  31.87 
 
 		 310 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  37.79 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  36.84 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  36.84 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  40.29 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  34.52 
 
 		 322 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 298 aa  150  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  32.84 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  35.05 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  36.12 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  37.09 
 
 		 305 aa  149  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  35.89 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  35.85 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  38.57 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  34.62 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  30.03 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  33.7 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  35.27 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  40.69 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  32.35 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  32.56 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  31.82 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  31.67 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  36.57 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  33.97 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0617  ABC transporter related  34.62 
 
 		 243 aa  146  5e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.854528 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  36.87 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.83 
 
 		 312 aa  145  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  33.72 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  38.65 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  32.7 
 
 		 369 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  38.28 
 
 		 298 aa  145  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 331 aa  145  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  38.21 
 
 		 331 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  33.94 
 
 		 320 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  37.5 
 
 		 373 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  33.94 
 
 		 320 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  36.87 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  38.68 
 
 		 328 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  35.78 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  38.42 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  32.54 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  33.85 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  32.54 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  37.09 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  31.1 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  35.55 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  33.92 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  36.32 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  31.6 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  36.62 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  31.14 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  34.76 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.15 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  37.02 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.97 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  32.95 
 
 		 304 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  40.64 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  33.97 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  32.96 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  30.97 
 
 		 329 aa  142  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2667  ABC transporter  40.85 
 
 		 239 aa  142  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  31.42 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  38.1 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  30.92 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  37.02 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  28.94 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  35.1 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  35.32 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  33.49 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>