200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1532 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  90.57 
 
 
1018 aa  1717  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  56.48 
 
 
1018 aa  1004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  53.24 
 
 
1018 aa  939  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  62.87 
 
 
1018 aa  1103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  7.99023e-11 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  54.32 
 
 
1018 aa  952  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  62.28 
 
 
1018 aa  1135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  3.95857e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  100 
 
 
1018 aa  2039  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  51.57 
 
 
1018 aa  885  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  6.27318e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  62.57 
 
 
1018 aa  1128  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  62.08 
 
 
1018 aa  1092  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  1.00584e-08 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  89.88 
 
 
1018 aa  1712  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  90.47 
 
 
1018 aa  1714  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  1.73958e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  46.19 
 
 
1020 aa  765  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  90.57 
 
 
1018 aa  1716  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  39.57 
 
 
1018 aa  587  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  36.99 
 
 
1018 aa  550  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  32.61 
 
 
1020 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  34.63 
 
 
1020 aa  422  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  30.21 
 
 
1029 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  6.58197e-05  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  29.19 
 
 
1049 aa  379  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  29.54 
 
 
1029 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  28.45 
 
 
1039 aa  369  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  29.04 
 
 
1029 aa  365  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  29.04 
 
 
1029 aa  365  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  29.13 
 
 
1029 aa  364  5e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  29.23 
 
 
1029 aa  363  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  29.19 
 
 
1029 aa  362  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  28.66 
 
 
1029 aa  360  6e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  28.18 
 
 
1029 aa  360  9e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  29.36 
 
 
1029 aa  359  1e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  28.56 
 
 
1029 aa  358  2e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  40.2 
 
 
1013 aa  328  5e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  29.26 
 
 
989 aa  284  7e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  30.32 
 
 
1024 aa  273  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  44.37 
 
 
1017 aa  201  4e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  54.05 
 
 
953 aa  198  4e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  24.98 
 
 
1085 aa  197  8e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  30.29 
 
 
1038 aa  195  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  30.4 
 
 
1033 aa  186  2e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  25.13 
 
 
1091 aa  185  4e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  25.71 
 
 
906 aa  185  4e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  41.82 
 
 
1081 aa  181  6e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  6.14784e-08 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  33.23 
 
 
1009 aa  177  1e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  33.23 
 
 
1009 aa  177  1e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  51.79 
 
 
1006 aa  175  4e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  49.4 
 
 
1009 aa  174  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  23.63 
 
 
961 aa  165  4e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  36.36 
 
 
995 aa  160  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  26.07 
 
 
904 aa  159  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  48.19 
 
 
1025 aa  158  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06659e-07 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  22.35 
 
 
1108 aa  156  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  33.79 
 
 
881 aa  155  3e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  42.11 
 
 
1022 aa  152  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  37.72 
 
 
986 aa  150  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  37.86 
 
 
986 aa  147  8e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  40.11 
 
 
1291 aa  146  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  35.27 
 
 
1047 aa  146  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  40.31 
 
 
995 aa  145  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  36.88 
 
 
1023 aa  145  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  39.69 
 
 
962 aa  144  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  39.55 
 
 
1046 aa  136  2e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  26.45 
 
 
1114 aa  134  8e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  36.82 
 
 
1011 aa  134  1e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  27.73 
 
 
1116 aa  132  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  50.29 
 
 
1058 aa  132  4e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  37.06 
 
 
1249 aa  128  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  34.72 
 
 
1046 aa  128  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  32.59 
 
 
1223 aa  122  2e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  40.31 
 
 
1191 aa  120  1e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  39.23 
 
 
1346 aa  120  2e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  32.09 
 
 
1219 aa  117  9e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  33.17 
 
 
1009 aa  117  9e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  37.38 
 
 
1165 aa  115  4e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.89262e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  39.08 
 
 
1059 aa  115  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  33.64 
 
 
1224 aa  112  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  36.98 
 
 
1137 aa  112  4e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  34.33 
 
 
810 aa  112  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  35.78 
 
 
1214 aa  111  7e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  37.37 
 
 
1214 aa  110  9e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  23.28 
 
 
1031 aa  110  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  1.02622e-07 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  37.87 
 
 
1230 aa  109  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  35.56 
 
 
1211 aa  109  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  35.5 
 
 
1223 aa  108  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  36.99 
 
 
1234 aa  108  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  34.09 
 
 
1238 aa  108  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  39.13 
 
 
1213 aa  108  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  35.56 
 
 
1211 aa  108  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  33.18 
 
 
1164 aa  108  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  35.45 
 
 
1307 aa  107  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  34.17 
 
 
815 aa  106  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  38.37 
 
 
1214 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  43.07 
 
 
1303 aa  106  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  33.62 
 
 
1227 aa  106  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  38.37 
 
 
1214 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  35.56 
 
 
1226 aa  105  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  38.37 
 
 
1214 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  38.26 
 
 
1155 aa  105  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  32.03 
 
 
1227 aa  105  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  37.93 
 
 
1101 aa  105  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  37.79 
 
 
1214 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.291963 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>